194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0040 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  58.84 
 
 		 603 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  58.12 
 
 		 601 aa  673    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  55.02 
 
 		 599 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1228    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  57.76 
 
 		 601 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  57.58 
 
 		 601 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  57.61 
 
 		 602 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  61.24 
 
 		 583 aa  722    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  57.58 
 
 		 601 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  56.5 
 
 		 619 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  58.66 
 
 		 603 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  58.66 
 
 		 603 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  56.58 
 
 		 594 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  58.12 
 
 		 603 aa  667    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  58.48 
 
 		 603 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  54.59 
 
 		 599 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  52.32 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  51.29 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  52.7 
 
 		 599 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  48.76 
 
 		 587 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  46.05 
 
 		 588 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  47.73 
 
 		 590 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  42.63 
 
 		 613 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  46.86 
 
 		 621 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  42.35 
 
 		 598 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.29 
 
 		 1283 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  44 
 
 		 584 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  41.21 
 
 		 593 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  41.86 
 
 		 586 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  36.44 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.65 
 
 		 611 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  36.98 
 
 		 609 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  36.65 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  35.73 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  34.48 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  35.61 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  35.79 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  35.44 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  35.55 
 
 		 616 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  35.61 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.43 
 
 		 609 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  36.38 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  35.14 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  35.66 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  35.47 
 
 		 616 aa  363  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  37.76 
 
 		 611 aa  361  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  35.75 
 
 		 610 aa  359  8e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  35.04 
 
 		 629 aa  350  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  34.68 
 
 		 619 aa  349  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  34.57 
 
 		 637 aa  347  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  34.22 
 
 		 635 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  34.79 
 
 		 615 aa  339  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  34.84 
 
 		 617 aa  339  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  34.97 
 
 		 615 aa  339  9e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  36.17 
 
 		 608 aa  339  9e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  32.7 
 
 		 627 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  33.86 
 
 		 613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  35.73 
 
 		 592 aa  336  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  33.68 
 
 		 615 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  37.46 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  35.82 
 
 		 608 aa  335  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  34.41 
 
 		 616 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  33.73 
 
 		 610 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  34.27 
 
 		 615 aa  333  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  34.41 
 
 		 616 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  34.24 
 
 		 616 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  33.85 
 
 		 628 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  34.14 
 
 		 616 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.96 
 
 		 625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  33.11 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  32.14 
 
 		 617 aa  319  9e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  31.91 
 
 		 614 aa  319  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  33.63 
 
 		 610 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  34.35 
 
 		 566 aa  317  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  34 
 
 		 593 aa  316  6e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  33.39 
 
 		 625 aa  316  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  32.76 
 
 		 589 aa  313  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.1 
 
 		 605 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  31.75 
 
 		 593 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  33.09 
 
 		 618 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  32.99 
 
 		 618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  34.63 
 
 		 614 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  34.81 
 
 		 614 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  34.56 
 
 		 614 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.81 
 
 		 614 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  41.49 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  31.06 
 
 		 646 aa  300  7e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  33.64 
 
 		 622 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  32 
 
 		 624 aa  299  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  34.26 
 
 		 617 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  33.83 
 
 		 607 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  33.83 
 
 		 607 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  33.83 
 
 		 607 aa  296  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  36.42 
 
 		 628 aa  290  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  32.6 
 
 		 611 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  33.64 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  29.39 
 
 		 602 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  39.33 
 
 		 629 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  30.59 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  32.67 
 
 		 628 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>