194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1831 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1261    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  77.76 
 
 		 616 aa  994    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  75.57 
 
 		 610 aa  972    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  75.04 
 
 		 607 aa  973    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  89.49 
 
 		 609 aa  1143    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  94.25 
 
 		 609 aa  1205    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  93.6 
 
 		 609 aa  1194    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  89.49 
 
 		 609 aa  1144    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  79.76 
 
 		 609 aa  989    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  93.29 
 
 		 611 aa  1191    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  79.01 
 
 		 609 aa  1007    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  89.66 
 
 		 609 aa  1144    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  79.8 
 
 		 611 aa  1019    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  89.82 
 
 		 609 aa  1140    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  89.16 
 
 		 609 aa  1138    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  76.01 
 
 		 616 aa  989    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  43.83 
 
 		 629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  45.31 
 
 		 592 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  41.05 
 
 		 637 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  42.19 
 
 		 635 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  40.95 
 
 		 611 aa  467  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  43.84 
 
 		 621 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  39.71 
 
 		 646 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  39.09 
 
 		 589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  40.39 
 
 		 619 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  39.63 
 
 		 1283 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  37.57 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  37.62 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  35.26 
 
 		 601 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  38.22 
 
 		 615 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  35.26 
 
 		 601 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.24 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.49 
 
 		 601 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.78 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  38.38 
 
 		 615 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.93 
 
 		 601 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  38.38 
 
 		 615 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  36.67 
 
 		 616 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  36.51 
 
 		 616 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  34.55 
 
 		 603 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.32 
 
 		 603 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  36.64 
 
 		 616 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  38.06 
 
 		 616 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.16 
 
 		 603 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  36.36 
 
 		 614 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  34.38 
 
 		 603 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.99 
 
 		 603 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  38.04 
 
 		 617 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  36.76 
 
 		 605 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  35.73 
 
 		 589 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  36.16 
 
 		 619 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  36.01 
 
 		 628 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  36.68 
 
 		 624 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.39 
 
 		 602 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  36.26 
 
 		 613 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  36.59 
 
 		 627 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  36.33 
 
 		 617 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.38 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  36.23 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  33.95 
 
 		 599 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.88 
 
 		 591 aa  363  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  35.67 
 
 		 625 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  38.46 
 
 		 611 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  39.11 
 
 		 614 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  36.42 
 
 		 613 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  37.79 
 
 		 614 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  35.57 
 
 		 583 aa  361  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  37.92 
 
 		 614 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  35.06 
 
 		 625 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  38.02 
 
 		 614 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  36.2 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  35.06 
 
 		 602 aa  355  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  37.66 
 
 		 617 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  36.2 
 
 		 607 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  36.2 
 
 		 607 aa  355  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.55 
 
 		 618 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  37.07 
 
 		 590 aa  353  5.9999999999999994e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  37.89 
 
 		 599 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  36.1 
 
 		 584 aa  350  6e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  36.64 
 
 		 605 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.04 
 
 		 618 aa  347  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  37.81 
 
 		 588 aa  346  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  36.21 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.04 
 
 		 608 aa  344  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  37.64 
 
 		 586 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.64 
 
 		 595 aa  340  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  39.59 
 
 		 622 aa  333  4e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  35.83 
 
 		 628 aa  331  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  31.93 
 
 		 613 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  35.34 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  34.91 
 
 		 621 aa  323  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  32.78 
 
 		 610 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  40.62 
 
 		 593 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  33.28 
 
 		 633 aa  307  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  32.8 
 
 		 628 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  32.56 
 
 		 621 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  34.02 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  32.64 
 
 		 608 aa  300  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  33.7 
 
 		 635 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  32.47 
 
 		 608 aa  298  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>