193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0043 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  50.66 
 
 		 617 aa  648    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  50.57 
 
 		 615 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  50.99 
 
 		 616 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1289    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  50.74 
 
 		 615 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  50.57 
 
 		 615 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  53.47 
 
 		 618 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  50.74 
 
 		 615 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  51.97 
 
 		 614 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  50.57 
 
 		 616 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  53.89 
 
 		 613 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  66.94 
 
 		 617 aa  874    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  51.05 
 
 		 627 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  50.49 
 
 		 616 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  51.57 
 
 		 613 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  50.99 
 
 		 616 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  51.74 
 
 		 624 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  50.32 
 
 		 625 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  50.17 
 
 		 628 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  49.1 
 
 		 602 aa  621  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  50.84 
 
 		 625 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  51.06 
 
 		 605 aa  596  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  45.28 
 
 		 628 aa  524  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  42.21 
 
 		 629 aa  508  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  41.7 
 
 		 608 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  42.36 
 
 		 614 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  42.07 
 
 		 614 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  41.84 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  41.84 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  41.84 
 
 		 607 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  43.16 
 
 		 611 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  41.41 
 
 		 617 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  41.49 
 
 		 614 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  41.49 
 
 		 614 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  40.98 
 
 		 622 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  35.05 
 
 		 607 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  36.22 
 
 		 616 aa  364  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  34.99 
 
 		 616 aa  360  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  34.34 
 
 		 609 aa  359  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  33.6 
 
 		 611 aa  359  8e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  34.61 
 
 		 610 aa  357  5e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  33.96 
 
 		 609 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  33.86 
 
 		 609 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  33.86 
 
 		 609 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  33.7 
 
 		 609 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.38 
 
 		 609 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.32 
 
 		 611 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  33.86 
 
 		 609 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  35.28 
 
 		 601 aa  350  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  35.18 
 
 		 601 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  34.39 
 
 		 609 aa  349  9e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  35.12 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  34.04 
 
 		 609 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  34.11 
 
 		 609 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  35.64 
 
 		 599 aa  342  9e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.1 
 
 		 1283 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  35.66 
 
 		 599 aa  342  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.79 
 
 		 585 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  34.53 
 
 		 591 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.53 
 
 		 601 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  36.2 
 
 		 630 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 603 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  34.69 
 
 		 629 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.5 
 
 		 603 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.09 
 
 		 603 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  34.87 
 
 		 611 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.28 
 
 		 603 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.93 
 
 		 603 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  37.36 
 
 		 619 aa  334  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  33.39 
 
 		 599 aa  332  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  33.17 
 
 		 621 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  34.11 
 
 		 602 aa  327  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  35.52 
 
 		 583 aa  326  8.000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.11 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  36.04 
 
 		 628 aa  325  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  33.85 
 
 		 594 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  31.94 
 
 		 635 aa  323  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.1 
 
 		 635 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  31.78 
 
 		 635 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.46 
 
 		 587 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  36.59 
 
 		 595 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  38 
 
 		 621 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  35.68 
 
 		 635 aa  316  7e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  35.92 
 
 		 636 aa  316  9e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  35.46 
 
 		 637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  33.09 
 
 		 589 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  34.41 
 
 		 605 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  35.49 
 
 		 639 aa  306  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  31.22 
 
 		 609 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  36.36 
 
 		 590 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  33.97 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  31.35 
 
 		 619 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  33.9 
 
 		 613 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  34.91 
 
 		 586 aa  297  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  30.89 
 
 		 610 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  31.42 
 
 		 605 aa  292  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  32.98 
 
 		 608 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  32.94 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  32.98 
 
 		 608 aa  289  9e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  34.15 
 
 		 589 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>