195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4732 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  61.81 
 
 		 595 aa  689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  86.36 
 
 		 603 aa  1094    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1245    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  65.06 
 
 		 599 aa  826    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  58.12 
 
 		 589 aa  673    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  94.01 
 
 		 601 aa  1182    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  94.51 
 
 		 601 aa  1186    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  73.45 
 
 		 602 aa  922    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  94.51 
 
 		 601 aa  1187    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  86.02 
 
 		 603 aa  1090    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  69.94 
 
 		 619 aa  905    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  72.79 
 
 		 591 aa  931    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  58.17 
 
 		 583 aa  679    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  86.36 
 
 		 603 aa  1093    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  73.62 
 
 		 594 aa  928    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  85.52 
 
 		 603 aa  1075    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  86.19 
 
 		 603 aa  1090    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  73.51 
 
 		 599 aa  930    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  73.21 
 
 		 599 aa  928    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  49.3 
 
 		 588 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  50.09 
 
 		 587 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  46.77 
 
 		 590 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  44.29 
 
 		 598 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  47.52 
 
 		 621 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  42.66 
 
 		 613 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  44.38 
 
 		 593 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.98 
 
 		 1283 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  42.83 
 
 		 586 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  41.18 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  36.45 
 
 		 619 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  34.51 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  34.93 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  34.93 
 
 		 609 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.77 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  35.89 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.27 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  34.76 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.81 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  34.93 
 
 		 609 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  34.43 
 
 		 609 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  36.04 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  34.78 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  39.12 
 
 		 621 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  33.39 
 
 		 616 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  32.89 
 
 		 616 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  35.23 
 
 		 607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  33.28 
 
 		 610 aa  362  9e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  34.56 
 
 		 629 aa  362  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  36.04 
 
 		 592 aa  360  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  34.87 
 
 		 585 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  34.99 
 
 		 617 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  34.63 
 
 		 610 aa  355  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  35.64 
 
 		 614 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  33.55 
 
 		 609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 617 aa  350  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.24 
 
 		 637 aa  342  8e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  35.09 
 
 		 615 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.73 
 
 		 625 aa  342  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  31.95 
 
 		 635 aa  340  4e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  33.17 
 
 		 602 aa  339  7e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  35.26 
 
 		 615 aa  339  8e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  35.26 
 
 		 615 aa  339  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  36.97 
 
 		 627 aa  339  9e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  35.45 
 
 		 618 aa  337  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  34.59 
 
 		 615 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  36.78 
 
 		 605 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  33.88 
 
 		 628 aa  336  7.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  35.28 
 
 		 616 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  35.28 
 
 		 616 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  35.18 
 
 		 616 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  34.05 
 
 		 613 aa  331  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  35.66 
 
 		 616 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  34.23 
 
 		 628 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  35.74 
 
 		 566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  34.17 
 
 		 625 aa  326  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  32.37 
 
 		 589 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.76 
 
 		 608 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  35.66 
 
 		 613 aa  325  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  34.69 
 
 		 610 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  35.21 
 
 		 607 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  34.58 
 
 		 608 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  35.21 
 
 		 607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  35.21 
 
 		 607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.57 
 
 		 605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  33.51 
 
 		 624 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  36.17 
 
 		 618 aa  316  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  37.91 
 
 		 593 aa  316  8e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  33.12 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  34.25 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  34.3 
 
 		 614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  34.76 
 
 		 614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  34.08 
 
 		 614 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.76 
 
 		 614 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  34.24 
 
 		 617 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.32 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  31.83 
 
 		 635 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  31.99 
 
 		 635 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  31.7 
 
 		 629 aa  297  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  31.99 
 
 		 635 aa  297  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  29.8 
 
 		 646 aa  296  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>