194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3072 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  82.16 
 
 		 609 aa  985    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  77.27 
 
 		 609 aa  993    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  71.71 
 
 		 607 aa  934    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  78.08 
 
 		 609 aa  1001    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  77.44 
 
 		 609 aa  993    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  77.93 
 
 		 609 aa  971    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  77.11 
 
 		 609 aa  991    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1277    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  77.92 
 
 		 611 aa  996    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  77.47 
 
 		 610 aa  1011    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  74.31 
 
 		 609 aa  960    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  77.44 
 
 		 609 aa  994    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  81.79 
 
 		 611 aa  1057    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  75.98 
 
 		 609 aa  971    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  77.11 
 
 		 609 aa  989    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  84.58 
 
 		 616 aa  1102    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  44.07 
 
 		 629 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  41.1 
 
 		 592 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  40.36 
 
 		 635 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  42.12 
 
 		 637 aa  488  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  41.9 
 
 		 611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  42.53 
 
 		 621 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  38.68 
 
 		 619 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.85 
 
 		 1283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  38.63 
 
 		 589 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  38.15 
 
 		 593 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  36.1 
 
 		 646 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  37.73 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  36.29 
 
 		 616 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  37.1 
 
 		 613 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  37.33 
 
 		 624 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  37.8 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  36.16 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  36.45 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  37.29 
 
 		 615 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  36.11 
 
 		 614 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  37.21 
 
 		 615 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  37.54 
 
 		 627 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  36.75 
 
 		 615 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  36.78 
 
 		 617 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  37.3 
 
 		 628 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  35.65 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  36.3 
 
 		 587 aa  379  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.55 
 
 		 601 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.55 
 
 		 603 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.39 
 
 		 603 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  35.44 
 
 		 613 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  33.66 
 
 		 601 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  37.7 
 
 		 605 aa  373  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.22 
 
 		 601 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.39 
 
 		 601 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.55 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.22 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  34.47 
 
 		 585 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  35.55 
 
 		 589 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  36.92 
 
 		 625 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  32.9 
 
 		 603 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  35.42 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  36.22 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  36.67 
 
 		 618 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  38.92 
 
 		 614 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  37.32 
 
 		 607 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  37.5 
 
 		 607 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  35.3 
 
 		 583 aa  360  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  37.32 
 
 		 607 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  34.7 
 
 		 619 aa  359  7e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  36.79 
 
 		 614 aa  359  9e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  37 
 
 		 614 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  36.92 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  34.1 
 
 		 599 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  33.28 
 
 		 625 aa  353  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  37.64 
 
 		 622 aa  353  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  38.31 
 
 		 611 aa  353  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.47 
 
 		 602 aa  353  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  35.2 
 
 		 591 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  36.98 
 
 		 617 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  34.87 
 
 		 595 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  35.16 
 
 		 599 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  36.76 
 
 		 590 aa  350  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  33.92 
 
 		 602 aa  350  5e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  37.07 
 
 		 586 aa  349  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  35.21 
 
 		 599 aa  348  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  34.95 
 
 		 629 aa  347  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  34.74 
 
 		 605 aa  346  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  35.98 
 
 		 584 aa  346  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.75 
 
 		 608 aa  342  9e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.78 
 
 		 628 aa  339  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  32.38 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  33.01 
 
 		 610 aa  330  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  32.98 
 
 		 613 aa  325  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  35.82 
 
 		 593 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  34.77 
 
 		 633 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  35.16 
 
 		 621 aa  318  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  34.03 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  33.44 
 
 		 628 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  32.16 
 
 		 608 aa  300  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  30.76 
 
 		 630 aa  297  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.98 
 
 		 608 aa  297  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  31.25 
 
 		 636 aa  291  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  31.8 
 
 		 551 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>