193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1105    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  59.6 
 
 		 547 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  47.92 
 
 		 546 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  34.72 
 
 		 603 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  39.04 
 
 		 610 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.35 
 
 		 603 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  34.36 
 
 		 594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.35 
 
 		 603 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  34.23 
 
 		 603 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.23 
 
 		 603 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  32.33 
 
 		 609 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.99 
 
 		 619 aa  316  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  32.33 
 
 		 609 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  32.1 
 
 		 609 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  32.32 
 
 		 601 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  35.79 
 
 		 599 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  32.16 
 
 		 609 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  32.92 
 
 		 611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  37.98 
 
 		 619 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  32.08 
 
 		 601 aa  312  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  33.45 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  32.08 
 
 		 601 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.84 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  32.33 
 
 		 610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  32.57 
 
 		 611 aa  310  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  32.03 
 
 		 609 aa  310  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  31.9 
 
 		 601 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  32.5 
 
 		 609 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  34.39 
 
 		 591 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  32.03 
 
 		 609 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  31.8 
 
 		 609 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  32.33 
 
 		 609 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  33.82 
 
 		 614 aa  306  7e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  31.98 
 
 		 609 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  31.92 
 
 		 616 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.94 
 
 		 1283 aa  303  7.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.39 
 
 		 617 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  32.16 
 
 		 616 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  34.87 
 
 		 610 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  32.26 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  30.59 
 
 		 589 aa  296  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.39 
 
 		 629 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  37.28 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.82 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  33.15 
 
 		 618 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  32.12 
 
 		 613 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  43.6 
 
 		 605 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  32.49 
 
 		 625 aa  286  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  36.57 
 
 		 599 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.79 
 
 		 613 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  31.54 
 
 		 616 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  31.54 
 
 		 616 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  31.54 
 
 		 616 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  31.54 
 
 		 616 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  35.59 
 
 		 613 aa  280  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  31.39 
 
 		 615 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  31.57 
 
 		 615 aa  279  8e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  31.46 
 
 		 615 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  30.5 
 
 		 627 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  30.91 
 
 		 615 aa  276  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.01 
 
 		 595 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  30.82 
 
 		 624 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  30.09 
 
 		 602 aa  273  7e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.78 
 
 		 608 aa  273  7e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34 
 
 		 583 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  30.36 
 
 		 628 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  34.59 
 
 		 608 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  30.16 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  33.79 
 
 		 618 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  37.42 
 
 		 625 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.99 
 
 		 587 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  30.74 
 
 		 637 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  34.48 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  33.46 
 
 		 614 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  33.07 
 
 		 614 aa  264  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  32.9 
 
 		 635 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  33.09 
 
 		 635 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  31.96 
 
 		 614 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  32.9 
 
 		 635 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  30.21 
 
 		 635 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  33.46 
 
 		 614 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  30.38 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  30.38 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  33.27 
 
 		 617 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  30.38 
 
 		 607 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  31.41 
 
 		 611 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  32.55 
 
 		 586 aa  259  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  31.87 
 
 		 621 aa  259  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  33.71 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  39.11 
 
 		 639 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  32.96 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  35.02 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  38.46 
 
 		 593 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  31.77 
 
 		 608 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  34.64 
 
 		 584 aa  256  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  35.29 
 
 		 598 aa  253  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  34.95 
 
 		 621 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  28.77 
 
 		 628 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  28.33 
 
 		 630 aa  243  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>