195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08886 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  56.39 
 
 
617 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  59.97 
 
 
616 aa  731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1254    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  60.63 
 
 
615 aa  729    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  57.52 
 
 
614 aa  724    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  55.03 
 
 
624 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  60.27 
 
 
615 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  60.45 
 
 
615 aa  741    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  60.31 
 
 
616 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  59.58 
 
 
618 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  59.93 
 
 
615 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  58.85 
 
 
625 aa  708    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  59.56 
 
 
616 aa  733    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  58.28 
 
 
613 aa  718    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  57.21 
 
 
627 aa  719    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  58.69 
 
 
628 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  60.35 
 
 
616 aa  729    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  57.24 
 
 
613 aa  700    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  51.62 
 
 
617 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  50 
 
 
618 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  49.92 
 
 
625 aa  618  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  46.19 
 
 
605 aa  539  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  42.01 
 
 
628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  41.46 
 
 
629 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  43.09 
 
 
614 aa  445  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  44.58 
 
 
607 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  44.58 
 
 
607 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  44.58 
 
 
607 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  42.86 
 
 
614 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  42.83 
 
 
614 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  41.73 
 
 
608 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  42.83 
 
 
614 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  42.5 
 
 
617 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  43.05 
 
 
611 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  42.77 
 
 
622 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  35.42 
 
 
607 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  33.97 
 
 
611 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.94 
 
 
611 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  35.21 
 
 
609 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  34.3 
 
 
609 aa  363  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.6 
 
 
1283 aa  363  6e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  35.92 
 
 
609 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  34.3 
 
 
609 aa  361  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  36.9 
 
 
630 aa  360  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  36.43 
 
 
616 aa  360  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  34.82 
 
 
609 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  34.5 
 
 
609 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  34.91 
 
 
609 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  34.5 
 
 
609 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  35.06 
 
 
609 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  34.29 
 
 
610 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  34.32 
 
 
585 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  34.74 
 
 
609 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  35.09 
 
 
616 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.06 
 
 
601 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.06 
 
 
601 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  32.9 
 
 
601 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  35.08 
 
 
605 aa  340  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  33.17 
 
 
601 aa  339  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  35.7 
 
 
628 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.7 
 
 
635 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  32.54 
 
 
635 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  32.54 
 
 
635 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.59 
 
 
629 aa  336  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.01 
 
 
602 aa  336  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.71 
 
 
603 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.39 
 
 
603 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.12 
 
 
603 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.99 
 
 
619 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.39 
 
 
603 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.55 
 
 
603 aa  330  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  32.41 
 
 
599 aa  330  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  31.7 
 
 
621 aa  329  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  35.11 
 
 
633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.15 
 
 
608 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.07 
 
 
591 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  33.97 
 
 
608 aa  324  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  33.45 
 
 
594 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.45 
 
 
588 aa  320  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.63 
 
 
587 aa  320  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  31.95 
 
 
599 aa  317  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  33.91 
 
 
637 aa  316  6e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  31.32 
 
 
636 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.58 
 
 
610 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  32.64 
 
 
605 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  33.59 
 
 
635 aa  313  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  34.95 
 
 
584 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  32.2 
 
 
583 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  34.52 
 
 
592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  31.66 
 
 
599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  34.13 
 
 
590 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  32.81 
 
 
604 aa  299  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  32.69 
 
 
611 aa  299  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  34.36 
 
 
621 aa  296  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  31.28 
 
 
609 aa  295  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.3 
 
 
595 aa  293  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  34.32 
 
 
586 aa  293  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  30.98 
 
 
613 aa  293  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 
619 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  32.41 
 
 
639 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>