194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1325 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  62.07 
 
 		 617 aa  805    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  72.08 
 
 		 616 aa  943    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  71.36 
 
 		 615 aa  918    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  66.08 
 
 		 624 aa  810    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  54.21 
 
 		 618 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  71.31 
 
 		 615 aa  922    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  71.64 
 
 		 615 aa  926    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  72.56 
 
 		 616 aa  948    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  71.75 
 
 		 618 aa  865    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  51.99 
 
 		 625 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  71.48 
 
 		 615 aa  923    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  71.13 
 
 		 625 aa  857    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1278    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  72.24 
 
 		 616 aa  946    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  76.27 
 
 		 613 aa  976    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  52.22 
 
 		 617 aa  665    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  71.65 
 
 		 628 aa  880    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  57.52 
 
 		 602 aa  724    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  71.92 
 
 		 616 aa  942    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  76.62 
 
 		 613 aa  1005    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  71.52 
 
 		 627 aa  949    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  49.19 
 
 		 605 aa  549  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  44.66 
 
 		 628 aa  505  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  41.21 
 
 		 629 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  42.06 
 
 		 608 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  43.33 
 
 		 607 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  43.33 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  43.33 
 
 		 607 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  42.86 
 
 		 614 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  42.58 
 
 		 614 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  42.68 
 
 		 617 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  42.21 
 
 		 611 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  42.6 
 
 		 614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  42.6 
 
 		 614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  43.21 
 
 		 622 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  38.5 
 
 		 607 aa  392  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  37.91 
 
 		 609 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  36.11 
 
 		 616 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  36.36 
 
 		 609 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  35.09 
 
 		 610 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  36.2 
 
 		 609 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  37.22 
 
 		 611 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  35.89 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  36.29 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  35.46 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  35.46 
 
 		 609 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  35.46 
 
 		 609 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  37.37 
 
 		 609 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  36 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  35.05 
 
 		 616 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  37.46 
 
 		 609 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.33 
 
 		 585 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.14 
 
 		 1283 aa  362  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  35.64 
 
 		 601 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  36.22 
 
 		 629 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.55 
 
 		 601 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  34.98 
 
 		 591 aa  349  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.39 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.89 
 
 		 601 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.32 
 
 		 603 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.15 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.31 
 
 		 599 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.83 
 
 		 603 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 603 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.83 
 
 		 602 aa  337  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  35.4 
 
 		 619 aa  336  9e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  32.43 
 
 		 628 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  33.28 
 
 		 636 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  33.23 
 
 		 635 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.14 
 
 		 587 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  33.39 
 
 		 635 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  36.33 
 
 		 583 aa  331  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  35.53 
 
 		 603 aa  332  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  30.33 
 
 		 630 aa  330  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  32.81 
 
 		 635 aa  330  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  33.78 
 
 		 599 aa  330  7e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  34.57 
 
 		 594 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.54 
 
 		 637 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  33.39 
 
 		 599 aa  327  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  32.37 
 
 		 635 aa  325  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  33.76 
 
 		 592 aa  323  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  32.3 
 
 		 605 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.66 
 
 		 610 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  37.11 
 
 		 584 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.26 
 
 		 608 aa  320  6e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.16 
 
 		 588 aa  320  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  36.98 
 
 		 621 aa  319  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  31.91 
 
 		 589 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  34.09 
 
 		 608 aa  316  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  34.88 
 
 		 590 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  32.17 
 
 		 621 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  34.11 
 
 		 595 aa  313  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  36.38 
 
 		 633 aa  311  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  34.14 
 
 		 586 aa  309  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  32.78 
 
 		 604 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  30.14 
 
 		 619 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  33.39 
 
 		 611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  31.45 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  31.88 
 
 		 605 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  33.82 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>