190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3964 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  74.47 
 
 		 635 aa  964    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  74.64 
 
 		 635 aa  969    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1272    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  74.31 
 
 		 635 aa  963    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  37.95 
 
 		 636 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  37.32 
 
 		 633 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  39.38 
 
 		 628 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  36.46 
 
 		 630 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  36.21 
 
 		 639 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  38.77 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.56 
 
 		 608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  37.44 
 
 		 610 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  37.41 
 
 		 605 aa  357  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  39.83 
 
 		 607 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  39.83 
 
 		 607 aa  350  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  39.83 
 
 		 607 aa  349  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  38.98 
 
 		 614 aa  349  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  39.33 
 
 		 611 aa  349  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  40.34 
 
 		 614 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  40.25 
 
 		 614 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  36.22 
 
 		 622 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  34.6 
 
 		 615 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  34.5 
 
 		 615 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  34.37 
 
 		 615 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  39.83 
 
 		 614 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  36.31 
 
 		 615 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  40.04 
 
 		 617 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  36.13 
 
 		 616 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  36.31 
 
 		 616 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  33.06 
 
 		 628 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  36.13 
 
 		 616 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  35.94 
 
 		 616 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  31.7 
 
 		 602 aa  329  8e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  33.22 
 
 		 618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  32.45 
 
 		 617 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  34.68 
 
 		 614 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  32.7 
 
 		 613 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.49 
 
 		 603 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  34.46 
 
 		 617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  32.17 
 
 		 614 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  34.4 
 
 		 613 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  34.39 
 
 		 604 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.02 
 
 		 601 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.8 
 
 		 591 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  33.12 
 
 		 601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  32.87 
 
 		 601 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  32.7 
 
 		 601 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.18 
 
 		 603 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.49 
 
 		 603 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.02 
 
 		 603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.97 
 
 		 627 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  34.09 
 
 		 605 aa  306  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  36.67 
 
 		 628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  34.6 
 
 		 594 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  32.49 
 
 		 609 aa  299  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  32.5 
 
 		 603 aa  299  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  32.97 
 
 		 607 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  31.93 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  32.09 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  34.77 
 
 		 619 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  35.8 
 
 		 625 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  32.91 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  32.91 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  32.91 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  31.37 
 
 		 599 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  32.1 
 
 		 616 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  33.07 
 
 		 609 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  33.49 
 
 		 611 aa  298  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.38 
 
 		 625 aa  297  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  32.76 
 
 		 611 aa  296  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.16 
 
 		 602 aa  296  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  32.07 
 
 		 624 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.64 
 
 		 618 aa  294  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  32.48 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.57 
 
 		 588 aa  290  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  31.56 
 
 		 629 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  31.73 
 
 		 585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  31.46 
 
 		 609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.31 
 
 		 1283 aa  285  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  31.85 
 
 		 616 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  31.94 
 
 		 609 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  32.65 
 
 		 599 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  34.82 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  33.75 
 
 		 586 aa  281  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  37.25 
 
 		 599 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  31.96 
 
 		 595 aa  277  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  31.21 
 
 		 610 aa  276  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.66 
 
 		 619 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  34.46 
 
 		 590 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  34.22 
 
 		 621 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  31.14 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.16 
 
 		 583 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  32.6 
 
 		 592 aa  256  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  28.78 
 
 		 610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  31.05 
 
 		 589 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  30.73 
 
 		 613 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.33 
 
 		 605 aa  252  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  30.37 
 
 		 589 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  31.87 
 
 		 551 aa  249  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  31.5 
 
 		 584 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>