193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3202 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  100 
 
 		 633 aa  1305    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  46.6 
 
 		 630 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  45.57 
 
 		 628 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  43.55 
 
 		 636 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  38.41 
 
 		 635 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  37.8 
 
 		 635 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  37.84 
 
 		 635 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  39.59 
 
 		 639 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  37.32 
 
 		 621 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  39.18 
 
 		 614 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  39.15 
 
 		 614 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  40.26 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  40.26 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  40.26 
 
 		 607 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  39.29 
 
 		 614 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  39.11 
 
 		 614 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  37.94 
 
 		 608 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  38.59 
 
 		 617 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  41.31 
 
 		 611 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  41.72 
 
 		 605 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  39.19 
 
 		 622 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  33.81 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  37.13 
 
 		 609 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  36.66 
 
 		 624 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  35.11 
 
 		 602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.26 
 
 		 611 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  37.2 
 
 		 610 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  36.11 
 
 		 614 aa  321  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  36.21 
 
 		 615 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  36.42 
 
 		 615 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  36.21 
 
 		 615 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  37.1 
 
 		 625 aa  318  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  43.49 
 
 		 616 aa  317  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  35.79 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  35.58 
 
 		 628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  34.21 
 
 		 616 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.64 
 
 		 627 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.45 
 
 		 618 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  36.38 
 
 		 614 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  35.98 
 
 		 616 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  35.36 
 
 		 616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  38.18 
 
 		 609 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  37.26 
 
 		 604 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  37.05 
 
 		 605 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  35.15 
 
 		 616 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  37.96 
 
 		 609 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  37.96 
 
 		 609 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  37.74 
 
 		 609 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  35.56 
 
 		 616 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  32.86 
 
 		 609 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  32.87 
 
 		 609 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  32.34 
 
 		 611 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  35.92 
 
 		 613 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  32.7 
 
 		 609 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  32.13 
 
 		 609 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  42.52 
 
 		 609 aa  303  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  35.06 
 
 		 625 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  32.44 
 
 		 607 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.09 
 
 		 628 aa  300  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  35.34 
 
 		 613 aa  300  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  37.09 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  31.65 
 
 		 610 aa  298  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  35.06 
 
 		 617 aa  297  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.19 
 
 		 1283 aa  294  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  34.23 
 
 		 629 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  58.48 
 
 		 227 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.85 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  33.54 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  34.82 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  34.37 
 
 		 610 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  35.6 
 
 		 608 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.68 
 
 		 583 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  35.6 
 
 		 608 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  34.46 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  36.71 
 
 		 591 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.79 
 
 		 587 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  30.63 
 
 		 594 aa  266  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  34.29 
 
 		 589 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.9 
 
 		 603 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  35.87 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  32.71 
 
 		 603 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.13 
 
 		 603 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  32.92 
 
 		 603 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.63 
 
 		 601 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.41 
 
 		 601 aa  259  9e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  35.51 
 
 		 599 aa  259  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.41 
 
 		 601 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.85 
 
 		 629 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.35 
 
 		 599 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  37.47 
 
 		 590 aa  257  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  36.14 
 
 		 619 aa  257  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.71 
 
 		 603 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  37.47 
 
 		 599 aa  256  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  37.3 
 
 		 586 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  34.86 
 
 		 621 aa  250  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  33.58 
 
 		 619 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  33.19 
 
 		 592 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  37.5 
 
 		 611 aa  248  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  38.24 
 
 		 588 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  36.07 
 
 		 595 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>