192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3456 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1238    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  56.77 
 
 		 604 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  48.84 
 
 		 609 aa  571  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  47.59 
 
 		 610 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  43.58 
 
 		 614 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  41.72 
 
 		 633 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  37.76 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  36.4 
 
 		 628 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  37.57 
 
 		 607 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  36.75 
 
 		 621 aa  360  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  37.57 
 
 		 607 aa  360  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  37.57 
 
 		 607 aa  360  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  37.85 
 
 		 614 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  37.41 
 
 		 617 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  37.67 
 
 		 614 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  36.84 
 
 		 614 aa  352  8e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  37.5 
 
 		 614 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  35.71 
 
 		 608 aa  345  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  34.39 
 
 		 630 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  35.79 
 
 		 635 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  35.69 
 
 		 622 aa  343  7e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  35.27 
 
 		 635 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  35.27 
 
 		 635 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  38.1 
 
 		 639 aa  339  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  35.27 
 
 		 613 aa  339  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  34.31 
 
 		 636 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  32.3 
 
 		 614 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  34.1 
 
 		 615 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  33.77 
 
 		 615 aa  323  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  33.39 
 
 		 625 aa  322  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  33.16 
 
 		 627 aa  319  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  33.11 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  33 
 
 		 615 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  34.42 
 
 		 617 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  31.91 
 
 		 602 aa  313  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  32.29 
 
 		 613 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.23 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  32.45 
 
 		 616 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  32.71 
 
 		 616 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  32.71 
 
 		 616 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  33.84 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  32.45 
 
 		 616 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  33 
 
 		 629 aa  300  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  32.2 
 
 		 624 aa  298  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 617 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  32.14 
 
 		 628 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  32.15 
 
 		 618 aa  294  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  33.39 
 
 		 625 aa  294  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  35 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  33.11 
 
 		 585 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  31.02 
 
 		 1283 aa  264  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  31.23 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  31.75 
 
 		 619 aa  259  9e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  31.43 
 
 		 611 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  29.98 
 
 		 616 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  31.13 
 
 		 607 aa  253  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  31.93 
 
 		 609 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  30.55 
 
 		 595 aa  249  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  32.24 
 
 		 605 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.35 
 
 		 608 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  32.75 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  31.76 
 
 		 609 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  31.76 
 
 		 609 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  31.42 
 
 		 609 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  31.53 
 
 		 602 aa  246  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  31.26 
 
 		 609 aa  246  9e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  30.95 
 
 		 588 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  30.95 
 
 		 613 aa  244  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.01 
 
 		 608 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.48 
 
 		 583 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  34.17 
 
 		 621 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  30.36 
 
 		 610 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  30.83 
 
 		 591 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  31.3 
 
 		 611 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  30.07 
 
 		 609 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  30.91 
 
 		 609 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  30.03 
 
 		 616 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  30.69 
 
 		 589 aa  239  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  31.09 
 
 		 609 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  31.42 
 
 		 587 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  31.51 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  31.51 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  31.34 
 
 		 603 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  30.7 
 
 		 599 aa  238  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  30.73 
 
 		 603 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  30.58 
 
 		 601 aa  237  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  30.58 
 
 		 601 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  31.51 
 
 		 599 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  51.83 
 
 		 227 aa  236  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  30.17 
 
 		 601 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  31.34 
 
 		 603 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  29.2 
 
 		 594 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  30.7 
 
 		 609 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.27 
 
 		 619 aa  233  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  30.63 
 
 		 601 aa  233  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.86 
 
 		 629 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  29.27 
 
 		 610 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  30.22 
 
 		 592 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  39.51 
 
 		 584 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  30.5 
 
 		 611 aa  225  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>