192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4257 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  65.65 
 
 		 628 aa  849    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  50.08 
 
 		 630 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1315    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  43.55 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  37.95 
 
 		 621 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  37.74 
 
 		 635 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  37.58 
 
 		 635 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  37.26 
 
 		 635 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  43.75 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  43.75 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  43.75 
 
 		 607 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  41.91 
 
 		 614 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  36.11 
 
 		 639 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  42.19 
 
 		 614 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  42.19 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  41.14 
 
 		 614 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  42.19 
 
 		 617 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  39.09 
 
 		 615 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  39.09 
 
 		 615 aa  364  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  35.28 
 
 		 609 aa  363  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  38.88 
 
 		 615 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  38.46 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  38.67 
 
 		 615 aa  361  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  35.56 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  37.84 
 
 		 628 aa  353  5e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  35.93 
 
 		 624 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  38.1 
 
 		 616 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  38.1 
 
 		 616 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  38.1 
 
 		 616 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  37.89 
 
 		 616 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  37.85 
 
 		 627 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  38.98 
 
 		 622 aa  347  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  33.28 
 
 		 614 aa  347  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  33.54 
 
 		 625 aa  346  6e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  34.51 
 
 		 605 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  38.24 
 
 		 613 aa  342  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.15 
 
 		 608 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  32.81 
 
 		 617 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  37.24 
 
 		 618 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.72 
 
 		 613 aa  330  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  35.92 
 
 		 618 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  35.6 
 
 		 625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  31.32 
 
 		 602 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  36.73 
 
 		 605 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  33.28 
 
 		 604 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  36.12 
 
 		 617 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  31.26 
 
 		 611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 		 614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  32.5 
 
 		 603 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  33.39 
 
 		 585 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  32.19 
 
 		 603 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.35 
 
 		 603 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.19 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.03 
 
 		 628 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  30.2 
 
 		 616 aa  297  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  30.94 
 
 		 616 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  32.03 
 
 		 603 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.98 
 
 		 601 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.98 
 
 		 601 aa  290  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.98 
 
 		 601 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  33.54 
 
 		 629 aa  289  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  31.99 
 
 		 602 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.51 
 
 		 619 aa  287  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  31.9 
 
 		 601 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  31.65 
 
 		 609 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  29.17 
 
 		 609 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  33.99 
 
 		 609 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.13 
 
 		 591 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  29.73 
 
 		 609 aa  283  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  29.73 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  30.03 
 
 		 1283 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  30.21 
 
 		 611 aa  281  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  28.85 
 
 		 609 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  29.6 
 
 		 609 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  33.02 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  30.03 
 
 		 609 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  29.4 
 
 		 610 aa  273  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  33.63 
 
 		 609 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  39.78 
 
 		 594 aa  272  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  31.98 
 
 		 595 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  32.11 
 
 		 587 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  28.78 
 
 		 609 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  32.61 
 
 		 589 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.28 
 
 		 599 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  33.33 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  36.82 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  37.78 
 
 		 588 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  30.35 
 
 		 592 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  30.83 
 
 		 605 aa  256  9e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.3 
 
 		 583 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  32.65 
 
 		 611 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  32.61 
 
 		 586 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  33.41 
 
 		 621 aa  250  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.96 
 
 		 619 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  33.85 
 
 		 608 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  32.16 
 
 		 629 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  36.11 
 
 		 584 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.22 
 
 		 608 aa  247  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  32.69 
 
 		 590 aa  246  6e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>