194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2867 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  62.28 
 
 		 617 aa  806    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  70.18 
 
 		 615 aa  917    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  72.06 
 
 		 616 aa  936    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  71.25 
 
 		 624 aa  882    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  54.45 
 
 		 618 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  57.79 
 
 		 602 aa  715    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  71.15 
 
 		 615 aa  924    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  71.31 
 
 		 615 aa  928    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  68.57 
 
 		 614 aa  908    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  53.45 
 
 		 617 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1283    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  71.64 
 
 		 615 aa  930    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  68.2 
 
 		 625 aa  845    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  72.06 
 
 		 616 aa  932    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  70.54 
 
 		 613 aa  908    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  72.06 
 
 		 628 aa  903    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  71.73 
 
 		 616 aa  931    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  67.43 
 
 		 613 aa  899    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  71.9 
 
 		 616 aa  932    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  67.57 
 
 		 627 aa  909    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  51.89 
 
 		 625 aa  625  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  51.32 
 
 		 605 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  45.9 
 
 		 628 aa  524  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  41 
 
 		 629 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  44.55 
 
 		 607 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  44.55 
 
 		 607 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  44.55 
 
 		 607 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  42.98 
 
 		 614 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  44.3 
 
 		 614 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  43.9 
 
 		 614 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  41.92 
 
 		 608 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  43.72 
 
 		 614 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  43.93 
 
 		 617 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  42.75 
 
 		 611 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  43.78 
 
 		 622 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  36.57 
 
 		 607 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  35.66 
 
 		 616 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  37.02 
 
 		 609 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  36.06 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  34.89 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  36.82 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  35.45 
 
 		 609 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  35.8 
 
 		 616 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  36.58 
 
 		 611 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  35.26 
 
 		 609 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  35.09 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  34.77 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  34.93 
 
 		 609 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  36.27 
 
 		 609 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  35.09 
 
 		 609 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  35.39 
 
 		 611 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  37.35 
 
 		 585 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  35.06 
 
 		 629 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  33.79 
 
 		 1283 aa  351  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  33.5 
 
 		 628 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  33.6 
 
 		 637 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  33.02 
 
 		 635 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.76 
 
 		 587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  36.94 
 
 		 591 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  36.01 
 
 		 599 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  37.9 
 
 		 583 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  35.17 
 
 		 601 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.43 
 
 		 599 aa  333  8e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  32.85 
 
 		 636 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.59 
 
 		 601 aa  330  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.59 
 
 		 601 aa  329  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.58 
 
 		 603 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  36.62 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.43 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.4 
 
 		 594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  35.78 
 
 		 605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.09 
 
 		 603 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  35.25 
 
 		 630 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.31 
 
 		 603 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  34.58 
 
 		 604 aa  323  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.44 
 
 		 603 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  33.5 
 
 		 609 aa  322  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  32.15 
 
 		 610 aa  320  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  35.78 
 
 		 619 aa  320  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  32.99 
 
 		 589 aa  319  9e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.78 
 
 		 608 aa  317  5e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  34.12 
 
 		 595 aa  316  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  35.45 
 
 		 633 aa  316  8e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  34.95 
 
 		 608 aa  316  8e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  34.31 
 
 		 588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.22 
 
 		 603 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.73 
 
 		 602 aa  310  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  35.4 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  31.34 
 
 		 635 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  32.01 
 
 		 635 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  32.87 
 
 		 611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.01 
 
 		 635 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  42.94 
 
 		 621 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  35.64 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  33.04 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  42.59 
 
 		 584 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  34.45 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  59.38 
 
 		 227 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  32.31 
 
 		 646 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  33.27 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>