195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2688 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  70.68 
 
 		 608 aa  914    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1649  hypothetical protein  92.61 
 
 		 352 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  64.14 
 
 		 622 aa  832    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  90.41 
 
 		 617 aa  1112    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  99.67 
 
 		 607 aa  1246    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 607 aa  1248    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  76.67 
 
 		 611 aa  942    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  99.84 
 
 		 607 aa  1247    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  90.41 
 
 		 614 aa  1115    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  90.08 
 
 		 614 aa  1107    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  88.45 
 
 		 614 aa  1090    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  90.58 
 
 		 614 aa  1116    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  49.9 
 
 		 615 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  43.84 
 
 		 627 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  49.9 
 
 		 615 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  47.93 
 
 		 615 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  48.86 
 
 		 615 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  98.24 
 
 		 227 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  44.71 
 
 		 617 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  48.45 
 
 		 616 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  48.66 
 
 		 616 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  43.33 
 
 		 614 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  48.45 
 
 		 616 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  48.25 
 
 		 616 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  46.95 
 
 		 625 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  48.13 
 
 		 628 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  42.31 
 
 		 613 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  43.51 
 
 		 624 aa  452  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  45.86 
 
 		 618 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  44.47 
 
 		 613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  44.58 
 
 		 602 aa  442  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  41.88 
 
 		 617 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  41.84 
 
 		 618 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  40.94 
 
 		 630 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  39.34 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  40.68 
 
 		 628 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  40.26 
 
 		 633 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  44.86 
 
 		 605 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  37.39 
 
 		 628 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  43.75 
 
 		 636 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  36.6 
 
 		 629 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  36.18 
 
 		 607 aa  361  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  37.5 
 
 		 616 aa  360  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  36.19 
 
 		 609 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  37.57 
 
 		 605 aa  360  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  36.36 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  38.49 
 
 		 611 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  36.36 
 
 		 609 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  36.01 
 
 		 609 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  36.38 
 
 		 609 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  37.98 
 
 		 616 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  36.83 
 
 		 585 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  38.1 
 
 		 609 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  36.13 
 
 		 609 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  37.43 
 
 		 610 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  36.19 
 
 		 609 aa  350  6e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  36.01 
 
 		 609 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  37.75 
 
 		 609 aa  350  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  39.83 
 
 		 621 aa  349  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  35.65 
 
 		 611 aa  349  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  36.41 
 
 		 635 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  36.41 
 
 		 635 aa  347  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  36.7 
 
 		 635 aa  346  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  38.42 
 
 		 609 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.47 
 
 		 1283 aa  333  6e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  36.79 
 
 		 639 aa  329  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.7 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  35.21 
 
 		 601 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.7 
 
 		 601 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.7 
 
 		 601 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.86 
 
 		 603 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.76 
 
 		 603 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  36.44 
 
 		 614 aa  317  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.94 
 
 		 594 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  34.69 
 
 		 603 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  35.21 
 
 		 603 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  39.09 
 
 		 610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  34.86 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  35.99 
 
 		 583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.52 
 
 		 603 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.66 
 
 		 605 aa  307  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  34.32 
 
 		 637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  35.17 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.38 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  34.12 
 
 		 635 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  35.41 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  36.15 
 
 		 611 aa  303  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  34.79 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  34.89 
 
 		 619 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  33.51 
 
 		 599 aa  299  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  33.83 
 
 		 589 aa  296  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  34.62 
 
 		 591 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  38.14 
 
 		 621 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  35.88 
 
 		 599 aa  293  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.09 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  34.24 
 
 		 599 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  32.24 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  37.36 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  38 
 
 		 608 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  36.09 
 
 		 621 aa  285  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>