194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1632 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  89.88 
 
 
609 aa  1117    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  74.35 
 
 
607 aa  953    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  90.31 
 
 
609 aa  1154    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  99.01 
 
 
609 aa  1251    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  90.15 
 
 
609 aa  1151    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  77.95 
 
 
609 aa  967    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  77.11 
 
 
616 aa  986    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  91.33 
 
 
611 aa  1157    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  75.08 
 
 
610 aa  964    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  98.69 
 
 
609 aa  1250    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  78.78 
 
 
609 aa  1014    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  99.18 
 
 
609 aa  1253    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  78.33 
 
 
611 aa  1005    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  89.82 
 
 
609 aa  1140    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1267    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  76.62 
 
 
616 aa  993    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  43.82 
 
 
629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  43.05 
 
 
592 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  42.02 
 
 
637 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  41.67 
 
 
635 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  41.05 
 
 
611 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  44.2 
 
 
621 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  39.28 
 
 
646 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  40.97 
 
 
589 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  39.67 
 
 
619 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.46 
 
 
1283 aa  434  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  37.59 
 
 
593 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  36.19 
 
 
616 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  36.72 
 
 
616 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  37.04 
 
 
615 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  36.35 
 
 
616 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.58 
 
 
603 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  34.15 
 
 
603 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.9 
 
 
603 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  36.35 
 
 
616 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.53 
 
 
585 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  38.92 
 
 
605 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.16 
 
 
601 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  36.45 
 
 
615 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  35.67 
 
 
594 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  34.42 
 
 
603 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.93 
 
 
601 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.42 
 
 
603 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  36.29 
 
 
615 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.16 
 
 
601 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  37.01 
 
 
627 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  35.46 
 
 
614 aa  379  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.67 
 
 
601 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  35.94 
 
 
615 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  36.84 
 
 
628 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  36.14 
 
 
587 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  36.75 
 
 
619 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  35.5 
 
 
617 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  36.71 
 
 
624 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  35.44 
 
 
589 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  35.71 
 
 
613 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  34.28 
 
 
599 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  35.79 
 
 
617 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  38.28 
 
 
611 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.8 
 
 
602 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  39.69 
 
 
614 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.79 
 
 
591 aa  365  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  33.01 
 
 
599 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  37.63 
 
 
614 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.17 
 
 
625 aa  363  7.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  36.69 
 
 
590 aa  362  9e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  39.01 
 
 
599 aa  362  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  37.17 
 
 
614 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  37.3 
 
 
614 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  36.36 
 
 
625 aa  360  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  36.01 
 
 
607 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  36.19 
 
 
607 aa  360  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  36.01 
 
 
607 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  37.19 
 
 
617 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  33.87 
 
 
613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  34.91 
 
 
602 aa  357  3.9999999999999996e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.8 
 
 
588 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.11 
 
 
618 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  36.1 
 
 
584 aa  352  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.07 
 
 
608 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  37.45 
 
 
586 aa  351  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.44 
 
 
618 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  36.46 
 
 
583 aa  349  8e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  35.53 
 
 
605 aa  349  9e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.57 
 
 
595 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  35.11 
 
 
629 aa  343  5e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  35.93 
 
 
622 aa  342  9e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  34.27 
 
 
613 aa  337  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  35.36 
 
 
621 aa  337  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  35.47 
 
 
598 aa  334  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.85 
 
 
628 aa  333  5e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  33.39 
 
 
610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  34.99 
 
 
593 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  32.82 
 
 
608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  37.74 
 
 
633 aa  306  7e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  32.85 
 
 
628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.33 
 
 
551 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  32.64 
 
 
608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  30.74 
 
 
610 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  33.7 
 
 
635 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>