190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2044 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
614 aa  1236    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  55.27 
 
 
610 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  44.03 
 
 
605 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  39.26 
 
 
609 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  40.92 
 
 
604 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  35.27 
 
 
635 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  35.1 
 
 
635 aa  331  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  35.27 
 
 
635 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  36.11 
 
 
633 aa  330  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  33.91 
 
 
630 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  37.06 
 
 
607 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  37.06 
 
 
607 aa  327  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  36.2 
 
 
607 aa  327  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  34.62 
 
 
621 aa  326  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  37.67 
 
 
614 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  37.67 
 
 
617 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  37.41 
 
 
614 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  37.41 
 
 
614 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.28 
 
 
608 aa  317  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  34.14 
 
 
628 aa  316  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  36.27 
 
 
611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  34.25 
 
 
639 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  34.96 
 
 
614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  33.92 
 
 
636 aa  292  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  33.28 
 
 
622 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  32.1 
 
 
625 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  30.31 
 
 
617 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  30.65 
 
 
615 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  30.08 
 
 
614 aa  272  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  31.42 
 
 
602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  30.3 
 
 
615 aa  270  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  35.75 
 
 
605 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  31 
 
 
615 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  31.27 
 
 
615 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  28.96 
 
 
613 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  30.34 
 
 
616 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  29.79 
 
 
616 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  29.52 
 
 
613 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  30.74 
 
 
625 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  30.34 
 
 
617 aa  264  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  33.63 
 
 
1283 aa  263  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  30.37 
 
 
616 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  30.11 
 
 
616 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  30.64 
 
 
627 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  31.71 
 
 
628 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.61 
 
 
605 aa  258  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  31.66 
 
 
585 aa  256  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  29.59 
 
 
624 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  28.79 
 
 
628 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  28.45 
 
 
618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  30.15 
 
 
618 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  27.54 
 
 
616 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  29.33 
 
 
611 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.64 
 
 
608 aa  231  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.82 
 
 
608 aa  231  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  29.19 
 
 
607 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  30.11 
 
 
592 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  31.71 
 
 
587 aa  228  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  30.09 
 
 
609 aa  226  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  31.51 
 
 
637 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  28.28 
 
 
610 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  28.46 
 
 
611 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  29.59 
 
 
603 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  29.98 
 
 
603 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  30.15 
 
 
603 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  29.98 
 
 
603 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  27.39 
 
 
591 aa  224  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  29.18 
 
 
619 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  32.02 
 
 
629 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  31.74 
 
 
635 aa  223  8e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  28.01 
 
 
609 aa  223  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  32.04 
 
 
590 aa  223  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  27.3 
 
 
616 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  28.99 
 
 
603 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  31.39 
 
 
613 aa  220  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  29.05 
 
 
610 aa  220  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  27.85 
 
 
609 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  29.7 
 
 
594 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  28.12 
 
 
609 aa  217  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  27.43 
 
 
609 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  27.99 
 
 
595 aa  216  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  29.98 
 
 
589 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  28.16 
 
 
601 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  28.3 
 
 
601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  28.23 
 
 
609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  28.28 
 
 
609 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  28.06 
 
 
601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  27.3 
 
 
609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  27.51 
 
 
609 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  29.48 
 
 
583 aa  210  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  28.5 
 
 
609 aa  210  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  27.84 
 
 
601 aa  208  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  28.46 
 
 
629 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  35.85 
 
 
547 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  29.53 
 
 
602 aa  206  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  28.45 
 
 
599 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  31.79 
 
 
584 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  32.17 
 
 
621 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  32.85 
 
 
593 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  36.61 
 
 
546 aa  203  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>