194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3489 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1222    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  45.63 
 
 		 603 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  43.87 
 
 		 594 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  45.63 
 
 		 603 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  43.24 
 
 		 591 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  45.63 
 
 		 603 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  45.44 
 
 		 603 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  42.83 
 
 		 601 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  45.25 
 
 		 603 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  42.48 
 
 		 601 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  42.66 
 
 		 601 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  44.87 
 
 		 601 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  44.55 
 
 		 619 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  40.96 
 
 		 587 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  45.45 
 
 		 599 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  44.87 
 
 		 602 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  44.49 
 
 		 599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  43.45 
 
 		 583 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  43.51 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  42.42 
 
 		 599 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  41.86 
 
 		 589 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  39.83 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  40.56 
 
 		 590 aa  412  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  38.07 
 
 		 1283 aa  392  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  38.18 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  38.39 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  37.05 
 
 		 607 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  37.07 
 
 		 616 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  38.19 
 
 		 613 aa  369  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  37.45 
 
 		 609 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  37.45 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  37.76 
 
 		 609 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  37.07 
 
 		 611 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  37.67 
 
 		 609 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  40.59 
 
 		 621 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  37.67 
 
 		 611 aa  363  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  37.07 
 
 		 609 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  37.64 
 
 		 609 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  36.5 
 
 		 616 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  37.64 
 
 		 609 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  37.67 
 
 		 609 aa  359  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  37.38 
 
 		 609 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  37.8 
 
 		 593 aa  352  8.999999999999999e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  36.4 
 
 		 609 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  36.8 
 
 		 610 aa  349  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  36.9 
 
 		 592 aa  343  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  32.14 
 
 		 629 aa  342  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  36.98 
 
 		 625 aa  335  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  33.56 
 
 		 585 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  37.62 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  35.2 
 
 		 611 aa  326  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  35.2 
 
 		 617 aa  322  9.000000000000001e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  35.78 
 
 		 613 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  35.22 
 
 		 619 aa  320  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  34.14 
 
 		 614 aa  319  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  35.04 
 
 		 615 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  35.04 
 
 		 615 aa  317  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.51 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  32.33 
 
 		 635 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  34.64 
 
 		 615 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  36.33 
 
 		 627 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  35.26 
 
 		 616 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  35.38 
 
 		 628 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.91 
 
 		 618 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  34.9 
 
 		 616 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  36.84 
 
 		 635 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 617 aa  309  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  48.93 
 
 		 605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  36.84 
 
 		 635 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  34.9 
 
 		 616 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  35.14 
 
 		 616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  36.66 
 
 		 635 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  35.03 
 
 		 624 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  34.5 
 
 		 613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  33.95 
 
 		 602 aa  303  6.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  35.31 
 
 		 628 aa  303  6.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.55 
 
 		 610 aa  300  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.78 
 
 		 608 aa  295  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  35.13 
 
 		 625 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  33.4 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.42 
 
 		 608 aa  290  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  34.46 
 
 		 629 aa  290  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  30.12 
 
 		 605 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  34.06 
 
 		 621 aa  286  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  33.2 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.18 
 
 		 618 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  30.06 
 
 		 593 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  34.01 
 
 		 611 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.36 
 
 		 551 aa  269  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.48 
 
 		 622 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  34.06 
 
 		 628 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  33.59 
 
 		 608 aa  267  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  29.63 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  32.65 
 
 		 614 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  32.65 
 
 		 614 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  32.45 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  32.46 
 
 		 614 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  32.45 
 
 		 607 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  32.45 
 
 		 607 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>