194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2373 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1149    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  36.65 
 
 
619 aa  348  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  35.33 
 
 
588 aa  346  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  36.64 
 
 
599 aa  346  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.89 
 
 
594 aa  343  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  34.64 
 
 
603 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.64 
 
 
603 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.64 
 
 
603 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.46 
 
 
603 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  34.34 
 
 
603 aa  340  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  38.37 
 
 
1283 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.1 
 
 
601 aa  333  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.1 
 
 
601 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.92 
 
 
601 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.17 
 
 
599 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.1 
 
 
601 aa  331  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  34.04 
 
 
591 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  35.88 
 
 
587 aa  326  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  33.92 
 
 
599 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.85 
 
 
602 aa  319  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  35.41 
 
 
621 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  35.06 
 
 
589 aa  317  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  37.09 
 
 
613 aa  312  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  36.92 
 
 
584 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  35.45 
 
 
598 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  36.64 
 
 
593 aa  310  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  32.45 
 
 
583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  31.84 
 
 
595 aa  306  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  38.19 
 
 
619 aa  290  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  34.71 
 
 
590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.75 
 
 
611 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.9 
 
 
609 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  34.9 
 
 
609 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  34.53 
 
 
616 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  34.91 
 
 
609 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  34.53 
 
 
609 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  34.53 
 
 
609 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  34.53 
 
 
609 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  34.53 
 
 
609 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  35.14 
 
 
610 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  34.53 
 
 
609 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  35.07 
 
 
611 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  32.69 
 
 
611 aa  276  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  31.88 
 
 
607 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  33.41 
 
 
616 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  32.82 
 
 
586 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  34.46 
 
 
609 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  32.96 
 
 
610 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  34.68 
 
 
609 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  30.57 
 
 
592 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  34.52 
 
 
629 aa  262  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  31.55 
 
 
589 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  31.99 
 
 
607 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  31.99 
 
 
607 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  31.99 
 
 
607 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.04 
 
 
605 aa  257  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  35.59 
 
 
625 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  42.94 
 
 
605 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  33.54 
 
 
593 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  29.86 
 
 
585 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  34.49 
 
 
614 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  32.41 
 
 
616 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  32.78 
 
 
616 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  32.59 
 
 
616 aa  250  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  32.59 
 
 
616 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  30.63 
 
 
617 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  36.75 
 
 
621 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  31.32 
 
 
614 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  34.14 
 
 
614 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  32.91 
 
 
625 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  33.63 
 
 
614 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  30.59 
 
 
618 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  32.5 
 
 
615 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  32.5 
 
 
615 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.67 
 
 
637 aa  243  7.999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  31.77 
 
 
635 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  32.04 
 
 
615 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  35.87 
 
 
608 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  30.36 
 
 
617 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  30.2 
 
 
613 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  34.98 
 
 
610 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  31.13 
 
 
614 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  31.29 
 
 
615 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  30.27 
 
 
611 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  35.06 
 
 
608 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  32.84 
 
 
628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  28.11 
 
 
602 aa  236  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  30.64 
 
 
628 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  29.79 
 
 
624 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.42 
 
 
608 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  33.75 
 
 
551 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  30.05 
 
 
622 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  29.54 
 
 
627 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  30.57 
 
 
617 aa  233  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  36.25 
 
 
629 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  34.57 
 
 
635 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.46 
 
 
613 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  34.35 
 
 
635 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  34.35 
 
 
635 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  30.61 
 
 
618 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>