190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0768 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
593 aa  1239    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  42.03 
 
 
592 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  43.97 
 
 
589 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  38.54 
 
 
611 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  38.15 
 
 
616 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  38.1 
 
 
609 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  38.1 
 
 
609 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  38.38 
 
 
609 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  38.1 
 
 
611 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  37.83 
 
 
616 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  37.66 
 
 
609 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  37.57 
 
 
609 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  37.31 
 
 
609 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  37.77 
 
 
609 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  37.59 
 
 
609 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  36.99 
 
 
607 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  37.23 
 
 
629 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  37.15 
 
 
609 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  37.59 
 
 
609 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  35.88 
 
 
610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  36.44 
 
 
637 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  37.03 
 
 
635 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  40.53 
 
 
621 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  35.22 
 
 
587 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  33.33 
 
 
646 aa  355  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  34.31 
 
 
611 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  35.92 
 
 
619 aa  342  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  32.98 
 
 
1283 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  32.09 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  32.32 
 
 
605 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.33 
 
 
591 aa  320  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.47 
 
 
602 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  33.1 
 
 
594 aa  312  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  32.92 
 
 
603 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.93 
 
 
603 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.03 
 
 
601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  32.74 
 
 
603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.03 
 
 
601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  31.97 
 
 
603 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  31.75 
 
 
589 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.84 
 
 
601 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  32.74 
 
 
619 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.25 
 
 
601 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  33.33 
 
 
599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  32.56 
 
 
603 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  29.86 
 
 
583 aa  298  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  35.28 
 
 
590 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  33.04 
 
 
624 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  30.95 
 
 
617 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  29.82 
 
 
588 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  31.22 
 
 
599 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  30.6 
 
 
599 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  32.23 
 
 
613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  30.41 
 
 
610 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  31.31 
 
 
618 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  31.45 
 
 
595 aa  279  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.88 
 
 
608 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  31.88 
 
 
621 aa  273  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  32.41 
 
 
605 aa  272  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.71 
 
 
608 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  31.52 
 
 
617 aa  267  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  31.93 
 
 
616 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  31.93 
 
 
616 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  31.52 
 
 
616 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  31.66 
 
 
614 aa  266  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  30.76 
 
 
613 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  31.47 
 
 
616 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  30.38 
 
 
615 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  30.2 
 
 
615 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  29.44 
 
 
615 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  30.84 
 
 
602 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  33.63 
 
 
598 aa  259  8e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  30.41 
 
 
628 aa  259  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  33.69 
 
 
625 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  29.9 
 
 
615 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  31.05 
 
 
627 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  31.22 
 
 
618 aa  257  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  31.93 
 
 
584 aa  257  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  30.06 
 
 
586 aa  256  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  38.1 
 
 
628 aa  256  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  31.94 
 
 
625 aa  256  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  30.78 
 
 
622 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  29.5 
 
 
613 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  33.98 
 
 
593 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  38.06 
 
 
629 aa  248  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  29.47 
 
 
608 aa  246  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  29.25 
 
 
607 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  29.25 
 
 
607 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  29.25 
 
 
607 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  28.8 
 
 
614 aa  243  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  29.83 
 
 
614 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  29.08 
 
 
614 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  29.08 
 
 
617 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  29.69 
 
 
614 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  30.53 
 
 
611 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  28.99 
 
 
609 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  28.89 
 
 
633 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  33.64 
 
 
635 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  33.41 
 
 
635 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  29.85 
 
 
628 aa  229  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>