194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0692 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
547 aa  1073    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  59.71 
 
 
551 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  57.25 
 
 
546 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  50.28 
 
 
610 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.65 
 
 
594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.38 
 
 
1283 aa  302  9e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  40.65 
 
 
609 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  40.21 
 
 
609 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  40.65 
 
 
609 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  40.65 
 
 
609 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  41.28 
 
 
619 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  39.26 
 
 
599 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  40.11 
 
 
609 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  41.3 
 
 
609 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  37.27 
 
 
601 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  40.92 
 
 
611 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  37.27 
 
 
601 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  41.85 
 
 
609 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  38.1 
 
 
591 aa  294  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  40.92 
 
 
609 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  37.21 
 
 
603 aa  293  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  37.5 
 
 
603 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  37.5 
 
 
603 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  37.41 
 
 
603 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  37.05 
 
 
601 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  40.38 
 
 
609 aa  291  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  37.18 
 
 
602 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  39.64 
 
 
619 aa  290  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  38.3 
 
 
618 aa  289  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  40.85 
 
 
609 aa  289  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  37.19 
 
 
603 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  38.44 
 
 
611 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  37.05 
 
 
601 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  37.67 
 
 
599 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  33.51 
 
 
607 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  39.34 
 
 
616 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  36.01 
 
 
595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  37.38 
 
 
616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  37.94 
 
 
617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  37.87 
 
 
599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  45.09 
 
 
605 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  33.87 
 
 
615 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  38.9 
 
 
610 aa  281  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  41.87 
 
 
615 aa  279  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  41.87 
 
 
615 aa  279  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  40.28 
 
 
624 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  41.87 
 
 
615 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  35.14 
 
 
613 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  41.3 
 
 
616 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  36.36 
 
 
618 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  41.3 
 
 
616 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  41.64 
 
 
616 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  36.93 
 
 
616 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  38.77 
 
 
613 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  41.37 
 
 
628 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  37.1 
 
 
585 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  38.48 
 
 
602 aa  270  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  41.78 
 
 
628 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  37.31 
 
 
614 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  39.15 
 
 
605 aa  268  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  41.89 
 
 
625 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  39.83 
 
 
593 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  36.89 
 
 
629 aa  266  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  32.19 
 
 
589 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  36.59 
 
 
637 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  40.87 
 
 
627 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  38.57 
 
 
625 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  36.7 
 
 
639 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  35.91 
 
 
635 aa  258  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  34.15 
 
 
607 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  34.15 
 
 
607 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  34.15 
 
 
607 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  37.81 
 
 
613 aa  256  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  34.01 
 
 
614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.86 
 
 
583 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  38.24 
 
 
621 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  37.17 
 
 
617 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  33.78 
 
 
614 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  36.7 
 
 
611 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  35.69 
 
 
590 aa  250  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  38.53 
 
 
610 aa  249  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  33.56 
 
 
614 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  33.56 
 
 
614 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  30.58 
 
 
633 aa  247  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  40.92 
 
 
611 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  33.56 
 
 
617 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  37.5 
 
 
584 aa  246  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  39.25 
 
 
609 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  34.15 
 
 
628 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  34.22 
 
 
630 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  38.1 
 
 
598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  39.2 
 
 
588 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  34.86 
 
 
621 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  40.91 
 
 
629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.48 
 
 
587 aa  240  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.39 
 
 
608 aa  239  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  37.75 
 
 
608 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  37.92 
 
 
608 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  38.64 
 
 
621 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  34.35 
 
 
593 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>