190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4531 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1182    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  42.75 
 
 		 602 aa  428  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  46 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  43.32 
 
 		 554 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  41.7 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  42.46 
 
 		 536 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  40.93 
 
 		 548 aa  334  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  33.9 
 
 		 590 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  33.98 
 
 		 590 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  33.9 
 
 		 590 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  33.27 
 
 		 596 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  33.75 
 
 		 590 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  33.81 
 
 		 590 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  33.28 
 
 		 596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  33.09 
 
 		 596 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  34.57 
 
 		 599 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  33.1 
 
 		 592 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  33.93 
 
 		 592 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  32.74 
 
 		 595 aa  302  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  32.92 
 
 		 590 aa  299  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  32.18 
 
 		 592 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  33.22 
 
 		 591 aa  294  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  32.76 
 
 		 609 aa  293  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  30.4 
 
 		 635 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  32.92 
 
 		 554 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  27.07 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  27.92 
 
 		 575 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  29.55 
 
 		 628 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  28 
 
 		 581 aa  163  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  27.29 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  26.73 
 
 		 502 aa  123  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  27.57 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  25.4 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  27.05 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  23.73 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  24.11 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  24.21 
 
 		 603 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  24.05 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  24.16 
 
 		 603 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  24.74 
 
 		 608 aa  100  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  25.09 
 
 		 561 aa  99.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  24.16 
 
 		 594 aa  99  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  26.94 
 
 		 583 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  22.42 
 
 		 1283 aa  97.8  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  27.46 
 
 		 522 aa  97.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  23.11 
 
 		 589 aa  97.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  24.4 
 
 		 608 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  24.68 
 
 		 619 aa  95.5  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  24.78 
 
 		 605 aa  95.1  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  26.31 
 
 		 559 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  23.5 
 
 		 496 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  23.64 
 
 		 591 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  23.19 
 
 		 588 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  26.75 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  25.08 
 
 		 609 aa  92  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  23.98 
 
 		 601 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  23.24 
 
 		 601 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  23.28 
 
 		 601 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3863  protein of unknown function DUF885  26.81 
 
 		 600 aa  90.9  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.292852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  22.83 
 
 		 601 aa  89.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  24.61 
 
 		 610 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02810  hypothetical protein  24.08 
 
 		 596 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  22.77 
 
 		 585 aa  88.2  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  23.34 
 
 		 624 aa  87.8  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  24.72 
 
 		 593 aa  87.8  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  28.19 
 
 		 607 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  28.19 
 
 		 607 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  24.51 
 
 		 599 aa  87.4  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  28.19 
 
 		 607 aa  87  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  23.46 
 
 		 590 aa  87  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  23.91 
 
 		 610 aa  87  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0262  hypothetical protein  24.73 
 
 		 621 aa  87  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  28.19 
 
 		 608 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  25.04 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  27.31 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  23.14 
 
 		 599 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  23.36 
 
 		 583 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  27.31 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  27.8 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.31 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  26.87 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  22.93 
 
 		 611 aa  81.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  26.87 
 
 		 617 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  31.16 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  24.24 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  31.21 
 
 		 616 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2038  hypothetical protein  25.57 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  22.67 
 
 		 599 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  21.29 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  27.78 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  22.52 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  27.78 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  27.78 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  29.83 
 
 		 621 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  28.32 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  27.78 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  27.78 
 
 		 616 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  26.71 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  29.17 
 
 		 607 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  29.01 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>