167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0197 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 578 aa  1153    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  46.37 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  45.96 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  41.7 
 
 		 582 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  43.24 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  43.28 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  34.6 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  32.7 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  32.93 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  31.42 
 
 		 590 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  32.3 
 
 		 592 aa  286  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  31.56 
 
 		 590 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  31.95 
 
 		 590 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  31.83 
 
 		 590 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  31.66 
 
 		 590 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  31.22 
 
 		 590 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  31.72 
 
 		 599 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  31.26 
 
 		 592 aa  276  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  30.87 
 
 		 596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  30.76 
 
 		 596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  30.58 
 
 		 596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  31.53 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  30.26 
 
 		 591 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  34.9 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  29.46 
 
 		 635 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  26.21 
 
 		 542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  27.01 
 
 		 628 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  28.74 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  25.43 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  29.06 
 
 		 506 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  26.99 
 
 		 502 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  29.25 
 
 		 583 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  25.35 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  29.34 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  26.9 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  27.38 
 
 		 1283 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  26.23 
 
 		 589 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  30.46 
 
 		 598 aa  63.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  27.22 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  24.86 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  24.86 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  24.86 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  24.86 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  24.86 
 
 		 614 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  25.81 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  24.86 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  27.47 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  24.86 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  28 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  24.29 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  28.41 
 
 		 619 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  22.5 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  25.28 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  24.29 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  26.9 
 
 		 611 aa  58.9  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  24.29 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  24.79 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  27.07 
 
 		 604 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  27.93 
 
 		 594 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  28.24 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  24.16 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  27.27 
 
 		 593 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  24.15 
 
 		 622 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  32.03 
 
 		 568 aa  57  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  25.9 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  23.73 
 
 		 611 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  25 
 
 		 595 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  27.01 
 
 		 599 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  30.17 
 
 		 610 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  28.57 
 
 		 610 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  24.86 
 
 		 628 aa  55.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  24.12 
 
 		 616 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  26.59 
 
 		 601 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  25.28 
 
 		 625 aa  54.7  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  26.86 
 
 		 621 aa  54.7  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1442  protein of unknown function DUF885  25.28 
 
 		 594 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  26.55 
 
 		 601 aa  54.3  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  26.55 
 
 		 601 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  25.42 
 
 		 602 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  26.52 
 
 		 629 aa  53.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  26.55 
 
 		 601 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  21.97 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  26.67 
 
 		 593 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  27.01 
 
 		 599 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  24.12 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  26.63 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  23.3 
 
 		 614 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  25.45 
 
 		 588 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  23.53 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  23.53 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  23.53 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  25.97 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  27.75 
 
 		 561 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  21.03 
 
 		 624 aa  51.6  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  26.55 
 
 		 603 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  22.16 
 
 		 618 aa  51.2  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  26.44 
 
 		 591 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  23.16 
 
 		 617 aa  51.2  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  26.55 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  26.55 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>