187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1279 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  61.88 
 
 
561 aa  684    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  58.11 
 
 
565 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1142    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  81.64 
 
 
561 aa  903    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  56.94 
 
 
561 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  54.01 
 
 
567 aa  590  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  51.95 
 
 
568 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  56.03 
 
 
577 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  54.39 
 
 
565 aa  558  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  53.96 
 
 
549 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  53.78 
 
 
549 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  53.78 
 
 
549 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  52.17 
 
 
547 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  50.63 
 
 
559 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  52 
 
 
544 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  50.81 
 
 
563 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  50.18 
 
 
560 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  52.26 
 
 
548 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  50.09 
 
 
556 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  47.57 
 
 
560 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  48.74 
 
 
556 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  49.19 
 
 
558 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  49.82 
 
 
542 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  49.65 
 
 
575 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  48.56 
 
 
559 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  46.25 
 
 
555 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  40.51 
 
 
543 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  40.39 
 
 
555 aa  350  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  40.18 
 
 
561 aa  331  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  36.07 
 
 
537 aa  274  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  28.3 
 
 
587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  27.4 
 
 
1283 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  28.34 
 
 
551 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  31.46 
 
 
599 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  31.07 
 
 
591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  26.69 
 
 
590 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  32.8 
 
 
599 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  25.57 
 
 
609 aa  148  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  30.85 
 
 
619 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  26.81 
 
 
611 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  29.97 
 
 
616 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  26.75 
 
 
589 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  26.8 
 
 
601 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  26.52 
 
 
603 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  26.8 
 
 
601 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  30.9 
 
 
603 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  32.05 
 
 
614 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  30.81 
 
 
594 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  29.48 
 
 
616 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  30.9 
 
 
603 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  26.08 
 
 
585 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  29.37 
 
 
614 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  30.62 
 
 
599 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  26.82 
 
 
605 aa  143  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  30.34 
 
 
603 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  25.95 
 
 
635 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  26.9 
 
 
607 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  26.63 
 
 
601 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  25.95 
 
 
637 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  26.9 
 
 
607 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  26.9 
 
 
607 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  27.06 
 
 
617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  30.56 
 
 
601 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  28.51 
 
 
613 aa  141  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  29.37 
 
 
614 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  32.92 
 
 
614 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  27.12 
 
 
610 aa  141  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  30.62 
 
 
603 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  29.66 
 
 
602 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  29.92 
 
 
583 aa  140  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  24.84 
 
 
609 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  26.04 
 
 
607 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  25.3 
 
 
609 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  26.03 
 
 
609 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  29.44 
 
 
609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  32.14 
 
 
609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  28.15 
 
 
595 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  29.44 
 
 
609 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  31.62 
 
 
593 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  29.44 
 
 
611 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  29.17 
 
 
609 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  24.61 
 
 
593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  24.66 
 
 
609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  24.96 
 
 
609 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  24.2 
 
 
611 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  25.51 
 
 
629 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  25.99 
 
 
593 aa  133  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  24.03 
 
 
610 aa  133  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  25.2 
 
 
592 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  27.67 
 
 
621 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  28.65 
 
 
609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  26.88 
 
 
608 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  27.61 
 
 
619 aa  130  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  27.41 
 
 
602 aa  130  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  30.47 
 
 
611 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  30.08 
 
 
621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  35.68 
 
 
227 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  28.64 
 
 
584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.79 
 
 
608 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  28.57 
 
 
598 aa  127  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>