182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1960 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 542 aa  1089    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  53.91 
 
 		 565 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  54.99 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  54.01 
 
 		 544 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  54.35 
 
 		 549 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  53.6 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  53.18 
 
 		 577 aa  525  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  53.6 
 
 		 549 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  51.62 
 
 		 568 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  54.11 
 
 		 555 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  52.98 
 
 		 561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  51.5 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  51.62 
 
 		 561 aa  509  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  49.82 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  49.64 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  51.15 
 
 		 565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  46.3 
 
 		 556 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  48.47 
 
 		 563 aa  458  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  45.36 
 
 		 556 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  43.16 
 
 		 560 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  49.08 
 
 		 548 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  43.63 
 
 		 560 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  44.48 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  45.89 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  46.4 
 
 		 559 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  43.03 
 
 		 575 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  40.97 
 
 		 543 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  36.64 
 
 		 555 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  36.33 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  37.97 
 
 		 537 aa  262  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  28.21 
 
 		 551 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  28.29 
 
 		 587 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  27.99 
 
 		 610 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  28.89 
 
 		 614 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  25.93 
 
 		 614 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  30.35 
 
 		 614 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  27.56 
 
 		 608 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  27.53 
 
 		 617 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  26.84 
 
 		 605 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  31.67 
 
 		 607 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  31.75 
 
 		 607 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  31.67 
 
 		 607 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  25.65 
 
 		 593 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  24.09 
 
 		 1283 aa  130  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  28.49 
 
 		 547 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  26.97 
 
 		 611 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  29.81 
 
 		 614 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  23.5 
 
 		 585 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  26.58 
 
 		 635 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  26.79 
 
 		 635 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  27.12 
 
 		 621 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  26.51 
 
 		 635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  24.48 
 
 		 622 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  25.63 
 
 		 599 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  25.79 
 
 		 619 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  28.5 
 
 		 546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  27.17 
 
 		 613 aa  118  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  33.79 
 
 		 227 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  24.08 
 
 		 601 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  23.12 
 
 		 616 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  24.08 
 
 		 601 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  23.94 
 
 		 601 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  33.04 
 
 		 628 aa  117  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  26.35 
 
 		 602 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  24.29 
 
 		 592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  27.02 
 
 		 619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  27.67 
 
 		 611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  23.21 
 
 		 609 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  23.83 
 
 		 616 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  26.84 
 
 		 594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  22.92 
 
 		 609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  26.35 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  23.23 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  26.35 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  25.78 
 
 		 599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  23.63 
 
 		 589 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  26.35 
 
 		 603 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  26.21 
 
 		 610 aa  115  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  27.37 
 
 		 598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  26.06 
 
 		 599 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  26.06 
 
 		 591 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  23.14 
 
 		 611 aa  114  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  23.55 
 
 		 601 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  23.05 
 
 		 603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  29.26 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  31.01 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  25.19 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  32.91 
 
 		 639 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  24.41 
 
 		 588 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  22.66 
 
 		 617 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  25.71 
 
 		 595 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  23.04 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  28.02 
 
 		 621 aa  107  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  23 
 
 		 607 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  23.04 
 
 		 609 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  22.86 
 
 		 609 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  25.91 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  25.35 
 
 		 609 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  32.65 
 
 		 608 aa  104  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  28.49 
 
 		 609 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>