182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0235 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1149    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  68.39 
 
 
560 aa  820    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  61.68 
 
 
556 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  63.1 
 
 
556 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  60.11 
 
 
559 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  53.06 
 
 
561 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  51.43 
 
 
568 aa  551  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  51.43 
 
 
565 aa  548  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  51.7 
 
 
559 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  50.8 
 
 
558 aa  508  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  50.18 
 
 
561 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  51.25 
 
 
577 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  47.59 
 
 
567 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  49.82 
 
 
561 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  49.55 
 
 
561 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  47.99 
 
 
575 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  48.75 
 
 
565 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  45.67 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  50.72 
 
 
548 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  46.15 
 
 
544 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  46.06 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  46.06 
 
 
549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  46.06 
 
 
549 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  43.52 
 
 
563 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  44.31 
 
 
542 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  41.94 
 
 
543 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  43.16 
 
 
555 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  41.68 
 
 
555 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  41.65 
 
 
561 aa  353  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  36.33 
 
 
537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  29.39 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  29.22 
 
 
614 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  29.04 
 
 
614 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  28.62 
 
 
607 aa  163  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  28.62 
 
 
607 aa  163  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  28.62 
 
 
607 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  29.17 
 
 
617 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  24.43 
 
 
585 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  26.12 
 
 
587 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  28.84 
 
 
611 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  28.17 
 
 
614 aa  153  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  26.17 
 
 
615 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  26.31 
 
 
615 aa  150  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  26.17 
 
 
615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  24.86 
 
 
619 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  23.77 
 
 
589 aa  148  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  25.36 
 
 
594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  25.39 
 
 
624 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  24.95 
 
 
1283 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  28.32 
 
 
608 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  24.47 
 
 
593 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  25.84 
 
 
605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  25.47 
 
 
617 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.21 
 
 
622 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  31.5 
 
 
609 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  24.86 
 
 
591 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  25.99 
 
 
551 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  25.95 
 
 
615 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  25.31 
 
 
601 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  24.15 
 
 
602 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  24.55 
 
 
601 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  24.55 
 
 
601 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  24.55 
 
 
601 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  24.01 
 
 
603 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  24.01 
 
 
603 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  24.01 
 
 
603 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  25.73 
 
 
616 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  24.91 
 
 
595 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  25.73 
 
 
616 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  23.83 
 
 
613 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  25.73 
 
 
616 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  25.9 
 
 
616 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  25.13 
 
 
592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  23.93 
 
 
616 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  29.53 
 
 
609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  23.91 
 
 
599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  23.7 
 
 
614 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  24.31 
 
 
625 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  24.01 
 
 
603 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  24.34 
 
 
599 aa  134  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  24.15 
 
 
616 aa  134  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  25 
 
 
607 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  29.03 
 
 
608 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  28.96 
 
 
609 aa  133  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  30.82 
 
 
629 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  25.63 
 
 
583 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  24.44 
 
 
542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  31.02 
 
 
605 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  30.99 
 
 
604 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  23.66 
 
 
603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  23.16 
 
 
602 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  23.29 
 
 
613 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  26.1 
 
 
610 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  23.52 
 
 
610 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  36.73 
 
 
227 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  28.53 
 
 
609 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  28.53 
 
 
611 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  24.16 
 
 
588 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  28.81 
 
 
609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  28.26 
 
 
609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>