183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3944 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 575 aa  1144    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  58.87 
 
 		 559 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  56.61 
 
 		 558 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  48.51 
 
 		 560 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  50.44 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  50.09 
 
 		 568 aa  496  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  49.13 
 
 		 559 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  48.69 
 
 		 560 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  50.09 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  49.22 
 
 		 561 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  49.65 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  50.53 
 
 		 561 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  47.31 
 
 		 565 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  47.22 
 
 		 567 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  47.29 
 
 		 561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  46.02 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  45.19 
 
 		 563 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  45.16 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  47.13 
 
 		 548 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  43.54 
 
 		 547 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  43.01 
 
 		 549 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  43.01 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  43.01 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  43.06 
 
 		 544 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  43.64 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  41.21 
 
 		 543 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  45.16 
 
 		 561 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  41.13 
 
 		 555 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  40.49 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  39.29 
 
 		 537 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  25.9 
 
 		 615 aa  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  25.96 
 
 		 615 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  25.8 
 
 		 615 aa  150  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  25.79 
 
 		 615 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  28.78 
 
 		 608 aa  149  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  23.83 
 
 		 585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  28.45 
 
 		 610 aa  146  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  25.59 
 
 		 630 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  38.14 
 
 		 607 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  31.07 
 
 		 609 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  38.14 
 
 		 607 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  38.14 
 
 		 607 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  38.5 
 
 		 614 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  38.5 
 
 		 614 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  38.01 
 
 		 633 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  38.14 
 
 		 614 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  24.83 
 
 		 614 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  25.96 
 
 		 625 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  38.03 
 
 		 614 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  37.21 
 
 		 227 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  31.94 
 
 		 605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  36.04 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  29.76 
 
 		 613 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  28.03 
 
 		 611 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  23.41 
 
 		 628 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  26.45 
 
 		 629 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  31.03 
 
 		 627 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  37.56 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  34.72 
 
 		 602 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  45.36 
 
 		 608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  38.91 
 
 		 608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  25.31 
 
 		 616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  23.75 
 
 		 613 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  23.92 
 
 		 616 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  29.21 
 
 		 609 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  25.17 
 
 		 616 aa  133  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  30.24 
 
 		 622 aa  133  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  26.17 
 
 		 594 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  27.15 
 
 		 609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  25.27 
 
 		 1283 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  25.89 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  27.15 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  27.15 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  27.15 
 
 		 609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  25.13 
 
 		 616 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  23.84 
 
 		 616 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  27.33 
 
 		 611 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  25 
 
 		 616 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  26.4 
 
 		 605 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  27.93 
 
 		 609 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  26.87 
 
 		 609 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  35.91 
 
 		 635 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  27.33 
 
 		 609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  25.42 
 
 		 621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  35.91 
 
 		 635 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  25.63 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  25.75 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  25.63 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  35.78 
 
 		 635 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  29.73 
 
 		 617 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  31.63 
 
 		 604 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  23.36 
 
 		 607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 		 614 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  33.95 
 
 		 617 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  28.15 
 
 		 587 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  36.02 
 
 		 551 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  25.58 
 
 		 603 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  25.71 
 
 		 603 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  24.95 
 
 		 635 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  27.94 
 
 		 611 aa  123  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>