183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2230 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  68.39 
 
 
560 aa  798    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  57.58 
 
 
556 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1154    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  56.86 
 
 
556 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  56.91 
 
 
559 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  49.29 
 
 
568 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  49.55 
 
 
565 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  48.74 
 
 
561 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  47.98 
 
 
575 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  47.83 
 
 
559 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  48.54 
 
 
558 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  47.57 
 
 
561 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  45.12 
 
 
567 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  46.58 
 
 
561 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  45.86 
 
 
561 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  45.12 
 
 
577 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  43.24 
 
 
547 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  43.91 
 
 
549 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  43.91 
 
 
549 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  45.23 
 
 
565 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  43.91 
 
 
549 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  45.49 
 
 
548 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  43.24 
 
 
544 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  43.16 
 
 
542 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  42.6 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  42.29 
 
 
555 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  41.04 
 
 
543 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  39.08 
 
 
555 aa  355  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  41.59 
 
 
561 aa  351  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  35.44 
 
 
537 aa  276  9e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  25.61 
 
 
593 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  25.75 
 
 
608 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  26.85 
 
 
615 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.29 
 
 
622 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  23.65 
 
 
602 aa  133  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  32.42 
 
 
614 aa  133  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  22.78 
 
 
585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  25.39 
 
 
615 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  25.09 
 
 
594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  25.56 
 
 
615 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  31.82 
 
 
614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  23.45 
 
 
617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  35.71 
 
 
609 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  28.57 
 
 
591 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  31.82 
 
 
614 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  27.64 
 
 
599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  31.86 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  23.38 
 
 
616 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  29.82 
 
 
611 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  31.52 
 
 
617 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  31.93 
 
 
607 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  28.14 
 
 
610 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  31.93 
 
 
607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  31.93 
 
 
607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  22.69 
 
 
611 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  26.99 
 
 
589 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  29.06 
 
 
611 aa  127  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  28 
 
 
602 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  29.91 
 
 
595 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  25.25 
 
 
615 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  29.52 
 
 
630 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  27.91 
 
 
599 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  28.3 
 
 
627 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  25.31 
 
 
605 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  23.69 
 
 
616 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.56 
 
 
608 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  28.29 
 
 
583 aa  123  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  28.23 
 
 
619 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  24.05 
 
 
625 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  22.94 
 
 
617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  24.35 
 
 
551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  31.08 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  21.96 
 
 
610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  28.5 
 
 
601 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  22.93 
 
 
618 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.09 
 
 
608 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  29.18 
 
 
1283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  24.49 
 
 
616 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  24.66 
 
 
616 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  28.57 
 
 
603 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  24.69 
 
 
547 aa  120  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  34.21 
 
 
227 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  24.48 
 
 
542 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  24.22 
 
 
628 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  28.29 
 
 
603 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  28.49 
 
 
601 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  26.55 
 
 
609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  28.29 
 
 
603 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  24.49 
 
 
616 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  28.29 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  37.64 
 
 
610 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  28.49 
 
 
601 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  27.51 
 
 
603 aa  118  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  28.25 
 
 
609 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  24.23 
 
 
616 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  27.07 
 
 
611 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  33.64 
 
 
633 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  23.01 
 
 
609 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  26.07 
 
 
609 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  25.1 
 
 
636 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>