187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1404 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 559 aa  1126    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  68.1 
 
 		 558 aa  718    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  58.51 
 
 		 575 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  53.87 
 
 		 556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  54.05 
 
 		 556 aa  567  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  53.5 
 
 		 559 aa  558  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  51.7 
 
 		 560 aa  541  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  51.07 
 
 		 565 aa  525  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  47.83 
 
 		 560 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  48.56 
 
 		 568 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  48.41 
 
 		 567 aa  498  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  50.36 
 
 		 561 aa  498  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  50.99 
 
 		 561 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  47.83 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  49.29 
 
 		 577 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  48.56 
 
 		 561 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  47.3 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  47.42 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  47.42 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  47.24 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  46.87 
 
 		 544 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  48.95 
 
 		 565 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  43.84 
 
 		 563 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  46.4 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  47.94 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  43.04 
 
 		 543 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  43.54 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  42.63 
 
 		 555 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  43.26 
 
 		 561 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  36.55 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  25.49 
 
 		 589 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  28.16 
 
 		 591 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  28.62 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  27.23 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  27.05 
 
 		 603 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  27.23 
 
 		 603 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  26.71 
 
 		 603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  25.31 
 
 		 585 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  26.96 
 
 		 601 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  33.98 
 
 		 614 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  32.9 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  32.9 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  32.9 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  27.85 
 
 		 610 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  26.88 
 
 		 603 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  26.79 
 
 		 601 aa  160  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  26.79 
 
 		 601 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  33.43 
 
 		 611 aa  160  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  30.7 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  27.89 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  28.7 
 
 		 589 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  30.9 
 
 		 608 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  26.87 
 
 		 601 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  33.99 
 
 		 614 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  33.99 
 
 		 614 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  26.09 
 
 		 592 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  28.1 
 
 		 1283 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  33.71 
 
 		 617 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  26.86 
 
 		 599 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  27.34 
 
 		 599 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.17 
 
 		 614 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  29.93 
 
 		 619 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  30.03 
 
 		 617 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  30.41 
 
 		 621 aa  150  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  33.13 
 
 		 633 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  29.25 
 
 		 590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  33.63 
 
 		 605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  25.64 
 
 		 611 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  24.39 
 
 		 616 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  28.07 
 
 		 621 aa  146  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  25.47 
 
 		 607 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  30.36 
 
 		 602 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.55 
 
 		 622 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  26.18 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  29.75 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  38.43 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  24.57 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  28.76 
 
 		 629 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  24.39 
 
 		 609 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  27.21 
 
 		 635 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  24.66 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  24.22 
 
 		 609 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  39.35 
 
 		 227 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  27.55 
 
 		 635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  25.09 
 
 		 616 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  25.13 
 
 		 609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  27.98 
 
 		 605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  26.33 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  25.09 
 
 		 609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  34.16 
 
 		 608 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  24.26 
 
 		 609 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  24.7 
 
 		 615 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  28.35 
 
 		 627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  27.46 
 
 		 618 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  33.65 
 
 		 604 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  28.7 
 
 		 602 aa  140  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  28.34 
 
 		 593 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  27.5 
 
 		 635 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  33.88 
 
 		 608 aa  140  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  25.17 
 
 		 609 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>