185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0847 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  65.49 
 
 		 565 aa  736    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  61.13 
 
 		 561 aa  673    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 567 aa  1157    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  66.25 
 
 		 577 aa  715    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  54.37 
 
 		 568 aa  580  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  54.01 
 
 		 561 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  56.38 
 
 		 565 aa  566  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  52.63 
 
 		 561 aa  552  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  53.72 
 
 		 561 aa  549  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  52.58 
 
 		 547 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  52.21 
 
 		 549 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  52.21 
 
 		 549 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  52.05 
 
 		 544 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  52.04 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  50.45 
 
 		 556 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  49.2 
 
 		 556 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  50.61 
 
 		 563 aa  525  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  49.47 
 
 		 559 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  51.68 
 
 		 542 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  47.59 
 
 		 560 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  51.25 
 
 		 548 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  48.48 
 
 		 555 aa  485  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  45.12 
 
 		 560 aa  485  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  48.41 
 
 		 559 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  47.05 
 
 		 575 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  46.71 
 
 		 558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  43.29 
 
 		 543 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  39.51 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  39.62 
 
 		 561 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  37.07 
 
 		 537 aa  269  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  29.61 
 
 		 622 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  27.14 
 
 		 607 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  27.14 
 
 		 607 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  27.14 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  26.88 
 
 		 614 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  27.31 
 
 		 611 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  26.88 
 
 		 614 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  26.42 
 
 		 589 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  29.53 
 
 		 619 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  29 
 
 		 591 aa  156  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.21 
 
 		 614 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  27.59 
 
 		 614 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  26.91 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  29.57 
 
 		 594 aa  154  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  29.23 
 
 		 551 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  26.69 
 
 		 599 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  28.09 
 
 		 1283 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  27.33 
 
 		 587 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  28.69 
 
 		 621 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  26.32 
 
 		 585 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  30.87 
 
 		 608 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  26.67 
 
 		 602 aa  150  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  30.43 
 
 		 608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  27.68 
 
 		 603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  27.37 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  27.68 
 
 		 603 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  27.68 
 
 		 603 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  27.74 
 
 		 599 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  27.47 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  29.14 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  27.21 
 
 		 608 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  28.42 
 
 		 599 aa  145  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  27.25 
 
 		 601 aa  143  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  27.25 
 
 		 601 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  27.25 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  28.88 
 
 		 611 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  27.77 
 
 		 610 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  30.72 
 
 		 635 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  30.81 
 
 		 635 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  30.52 
 
 		 635 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  26.23 
 
 		 588 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  27.54 
 
 		 590 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  31.48 
 
 		 628 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  31.89 
 
 		 629 aa  136  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  27.62 
 
 		 601 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  24.79 
 
 		 609 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  27.54 
 
 		 583 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  25.95 
 
 		 593 aa  135  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  27.19 
 
 		 633 aa  134  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  28.09 
 
 		 595 aa  133  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  26.41 
 
 		 625 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  28.39 
 
 		 613 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  28.82 
 
 		 609 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  25.09 
 
 		 593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  27.02 
 
 		 605 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  31.75 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  25.79 
 
 		 592 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  30.65 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  25.37 
 
 		 607 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  29.5 
 
 		 609 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  35.32 
 
 		 227 aa  130  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  29.5 
 
 		 611 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  27.81 
 
 		 628 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  27.08 
 
 		 602 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  28.8 
 
 		 609 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  29.81 
 
 		 609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  28.99 
 
 		 619 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  28.78 
 
 		 621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  29.5 
 
 		 609 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  25.29 
 
 		 630 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>