187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  69.04 
 
 		 565 aa  766    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  63.52 
 
 		 561 aa  686    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1157    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  66.25 
 
 		 567 aa  749    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  65.9 
 
 		 565 aa  656    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  55.52 
 
 		 568 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  55.85 
 
 		 561 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  55.79 
 
 		 547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  55.69 
 
 		 544 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  55.12 
 
 		 561 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  55.21 
 
 		 561 aa  568  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  55.3 
 
 		 549 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  55.3 
 
 		 549 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  55.48 
 
 		 549 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  54.61 
 
 		 563 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  52.75 
 
 		 556 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  51.25 
 
 		 560 aa  541  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  51.51 
 
 		 556 aa  537  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  51.94 
 
 		 559 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  53.36 
 
 		 542 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  56.46 
 
 		 548 aa  521  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  51.16 
 
 		 555 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  45.47 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  50 
 
 		 559 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  48.31 
 
 		 558 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  46.06 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  43.21 
 
 		 543 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  40.54 
 
 		 555 aa  336  7e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  41.25 
 
 		 561 aa  323  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  37.7 
 
 		 537 aa  287  5e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  31.3 
 
 		 619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  30 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  26.02 
 
 		 589 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  26.66 
 
 		 603 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  27.09 
 
 		 601 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  27.09 
 
 		 601 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  27.09 
 
 		 601 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  25.98 
 
 		 602 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  26.66 
 
 		 603 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  26.48 
 
 		 619 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  26.62 
 
 		 603 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  28.86 
 
 		 613 aa  158  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  26.32 
 
 		 603 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  24.74 
 
 		 585 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  27.07 
 
 		 601 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  26.16 
 
 		 603 aa  156  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  26.31 
 
 		 594 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  28.47 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  26.63 
 
 		 599 aa  153  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  27.48 
 
 		 610 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  28.67 
 
 		 614 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  28.67 
 
 		 614 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  25.87 
 
 		 621 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  28.5 
 
 		 614 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  26.74 
 
 		 608 aa  150  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  27.91 
 
 		 605 aa  150  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  26.03 
 
 		 611 aa  150  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  27.62 
 
 		 614 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  26.36 
 
 		 591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  26.29 
 
 		 1283 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  26.39 
 
 		 599 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  28.18 
 
 		 590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  29.28 
 
 		 608 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  29.45 
 
 		 608 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  26.69 
 
 		 635 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  28.01 
 
 		 607 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  28.01 
 
 		 607 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  28.01 
 
 		 607 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  28.32 
 
 		 617 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  26.69 
 
 		 635 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  26.53 
 
 		 635 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  27.8 
 
 		 611 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.52 
 
 		 622 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  27.27 
 
 		 583 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  30.53 
 
 		 546 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  25.26 
 
 		 588 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  26.14 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  27.17 
 
 		 599 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  24.33 
 
 		 611 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  28.55 
 
 		 639 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  24.46 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  27.18 
 
 		 595 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  31.74 
 
 		 593 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  32.9 
 
 		 628 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  24.19 
 
 		 609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  28.72 
 
 		 621 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  27.94 
 
 		 598 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  30.14 
 
 		 605 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  29.85 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  23.83 
 
 		 609 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  23.92 
 
 		 609 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  25.85 
 
 		 635 aa  134  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  23.36 
 
 		 616 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  24.45 
 
 		 586 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  36.92 
 
 		 227 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  29.14 
 
 		 628 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  25.04 
 
 		 637 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  28.92 
 
 		 609 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  24.68 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  23.13 
 
 		 616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>