186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1152    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  58.54 
 
 
561 aa  628  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  57.37 
 
 
565 aa  624  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  56.31 
 
 
561 aa  598  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  54.37 
 
 
567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  54.63 
 
 
577 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  51.95 
 
 
561 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  51.79 
 
 
547 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  53.51 
 
 
565 aa  538  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  51.43 
 
 
560 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  51.42 
 
 
561 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  52.41 
 
 
556 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  55.12 
 
 
548 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  52.05 
 
 
556 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  52.3 
 
 
559 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  49.29 
 
 
560 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  50.88 
 
 
563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  50.89 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  50.89 
 
 
549 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  50.89 
 
 
549 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  51.52 
 
 
544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  51.62 
 
 
542 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  50.09 
 
 
575 aa  475  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  48.5 
 
 
555 aa  472  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  48.82 
 
 
559 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  47.4 
 
 
558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  40.29 
 
 
543 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  39.22 
 
 
555 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  42.58 
 
 
561 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  36.75 
 
 
537 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  28.14 
 
 
594 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  26.05 
 
 
599 aa  164  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  27.04 
 
 
602 aa  163  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  26.54 
 
 
601 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  28.35 
 
 
635 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  27.01 
 
 
601 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  28.35 
 
 
635 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  27.32 
 
 
603 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  28.18 
 
 
635 aa  160  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  26.76 
 
 
601 aa  159  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  27.32 
 
 
603 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  27.32 
 
 
603 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  26.76 
 
 
601 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  27.47 
 
 
591 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  27.32 
 
 
603 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  26.98 
 
 
599 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  27.48 
 
 
619 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  27.15 
 
 
621 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  26.9 
 
 
603 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.14 
 
 
1283 aa  155  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  27.48 
 
 
625 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  26.69 
 
 
614 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  27.21 
 
 
614 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.38 
 
 
614 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  26.22 
 
 
607 aa  153  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  26.22 
 
 
607 aa  153  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  26.22 
 
 
607 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  25.17 
 
 
599 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  28.1 
 
 
595 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  25.62 
 
 
589 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  27.62 
 
 
611 aa  151  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  26.91 
 
 
614 aa  150  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  27.04 
 
 
617 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  28.52 
 
 
605 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  26.43 
 
 
608 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  25.77 
 
 
593 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  28.68 
 
 
619 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  25.59 
 
 
616 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  27.96 
 
 
587 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  24.04 
 
 
602 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  23.4 
 
 
627 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  31.25 
 
 
609 aa  144  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  25.3 
 
 
616 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  26.7 
 
 
588 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  26.44 
 
 
622 aa  143  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  24.92 
 
 
609 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  27.27 
 
 
608 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  24.92 
 
 
609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  26.75 
 
 
583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  24.92 
 
 
611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  25.12 
 
 
609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  26.92 
 
 
609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  28.28 
 
 
610 aa  141  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  24.45 
 
 
609 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  30.56 
 
 
609 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  25.6 
 
 
611 aa  140  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  30.56 
 
 
609 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  23.87 
 
 
585 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  30.79 
 
 
611 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  27.26 
 
 
608 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  24.91 
 
 
615 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  26.82 
 
 
592 aa  137  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  25 
 
 
615 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  25.76 
 
 
607 aa  135  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  29.15 
 
 
609 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  23.53 
 
 
613 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  25.09 
 
 
615 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  30.16 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  23.36 
 
 
618 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  27.37 
 
 
551 aa  133  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>