185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1193 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  60.11 
 
 
560 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
559 aa  1140    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  56.91 
 
 
560 aa  650    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  60 
 
 
556 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  58.93 
 
 
556 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  54.3 
 
 
561 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  52.04 
 
 
565 aa  568  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  53.5 
 
 
559 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  52.3 
 
 
568 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  50.18 
 
 
567 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  51.94 
 
 
577 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  50.63 
 
 
561 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  50.63 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  50.45 
 
 
561 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  50.52 
 
 
558 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  49.13 
 
 
575 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  50.18 
 
 
565 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  51.71 
 
 
548 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  48.67 
 
 
563 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  47.21 
 
 
547 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  46.87 
 
 
549 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  46.87 
 
 
549 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  46.87 
 
 
549 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  45.23 
 
 
544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  44.4 
 
 
555 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  44.88 
 
 
542 aa  425  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  41.53 
 
 
543 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  41.79 
 
 
555 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  42.33 
 
 
561 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  41.34 
 
 
537 aa  324  3e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  28.34 
 
 
1283 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  25.23 
 
 
602 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  24.59 
 
 
599 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  26.87 
 
 
587 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  25.85 
 
 
603 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  26.07 
 
 
603 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  24.15 
 
 
589 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  25.45 
 
 
619 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  25.89 
 
 
603 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  25.98 
 
 
594 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  25.89 
 
 
603 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  24.41 
 
 
591 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  25.54 
 
 
603 aa  150  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  25.67 
 
 
601 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  25.49 
 
 
601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  25.49 
 
 
601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  25.67 
 
 
601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  29.62 
 
 
609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  24.18 
 
 
585 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  25.47 
 
 
609 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  25.25 
 
 
609 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  31.96 
 
 
614 aa  145  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  24.83 
 
 
609 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  30.59 
 
 
595 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  27.54 
 
 
614 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  27.72 
 
 
614 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  25.13 
 
 
589 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  28.91 
 
 
592 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  24.92 
 
 
611 aa  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  28.65 
 
 
599 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  24.49 
 
 
611 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  27.54 
 
 
617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.83 
 
 
614 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  29.79 
 
 
607 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  24.48 
 
 
609 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  25.08 
 
 
609 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  31.87 
 
 
607 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  31.87 
 
 
607 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  25.65 
 
 
609 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  31.87 
 
 
607 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  24.83 
 
 
609 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  24.83 
 
 
609 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  30 
 
 
609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  30.14 
 
 
616 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  24.66 
 
 
609 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  30.9 
 
 
622 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  27.97 
 
 
583 aa  136  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  30.85 
 
 
621 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  35.78 
 
 
608 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  30.41 
 
 
611 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  25.57 
 
 
551 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  31.03 
 
 
633 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  26.94 
 
 
611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  32.17 
 
 
629 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  27.18 
 
 
617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  25.91 
 
 
610 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  25.65 
 
 
605 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  33.02 
 
 
639 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  29.4 
 
 
621 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  26.24 
 
 
610 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  29.21 
 
 
616 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  25.74 
 
 
602 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  34.23 
 
 
227 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  26.31 
 
 
635 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  31.78 
 
 
628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  25.94 
 
 
605 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  29.45 
 
 
635 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  25.1 
 
 
613 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  23.88 
 
 
599 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  24.91 
 
 
628 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>