185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1203 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1203  protein of unknown function DUF885  100 
 
 		 537 aa  1059    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.766483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  40.79 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  40.77 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  41.87 
 
 		 561 aa  321  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  41.23 
 
 		 543 aa  316  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  38.69 
 
 		 565 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3944  protein of unknown function DUF885  39.39 
 
 		 575 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1404  protein of unknown function DUF885  38 
 
 		 559 aa  309  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  41.02 
 
 		 565 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27920  hypothetical protein  37.88 
 
 		 558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.595519  normal  0.0193184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  38.21 
 
 		 568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  38.07 
 
 		 577 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0216  hypothetical protein  38.36 
 
 		 556 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166769  normal  0.0154007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  38.98 
 
 		 556 aa  299  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2230  hypothetical protein  35.99 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531151  decreased coverage  0.00593781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0847  protein of unknown function DUF885  37.07 
 
 		 567 aa  297  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.327552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0235  hypothetical protein  36.33 
 
 		 560 aa  296  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  38.93 
 
 		 547 aa  290  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1323  protein of unknown function DUF885  38.97 
 
 		 561 aa  289  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000137571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  38.93 
 
 		 549 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  38.75 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  38.75 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  38.79 
 
 		 544 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  38.97 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1960  protein of unknown function DUF885  39.06 
 
 		 542 aa  276  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0156  protein of unknown function DUF885  38.83 
 
 		 555 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  36.04 
 
 		 561 aa  273  8.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  36.63 
 
 		 561 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  35.48 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3910  protein of unknown function DUF885  38.62 
 
 		 548 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.607477  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  33.54 
 
 		 605 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  27.19 
 
 		 585 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  26.44 
 
 		 1283 aa  137  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  28.17 
 
 		 587 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  29.89 
 
 		 609 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  28.01 
 
 		 629 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  32.56 
 
 		 639 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  26.47 
 
 		 589 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  26.33 
 
 		 610 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  27.12 
 
 		 611 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  29.87 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  26.14 
 
 		 613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  28.98 
 
 		 619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  28.54 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  29.1 
 
 		 607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  29.1 
 
 		 607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  29.1 
 
 		 607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  27.84 
 
 		 637 aa  127  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  24.12 
 
 		 613 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  32.78 
 
 		 604 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  25.75 
 
 		 593 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  27.15 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  29.79 
 
 		 622 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  27.94 
 
 		 608 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  26.38 
 
 		 609 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  25 
 
 		 617 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  25.36 
 
 		 583 aa  124  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  34.93 
 
 		 614 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  29.08 
 
 		 635 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  28.22 
 
 		 613 aa  123  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  28.78 
 
 		 635 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  33.77 
 
 		 614 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  34.06 
 
 		 614 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  26.97 
 
 		 608 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  24.81 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  24.02 
 
 		 614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  29.81 
 
 		 605 aa  121  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  28.19 
 
 		 621 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  24.25 
 
 		 589 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  28.49 
 
 		 635 aa  120  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  24.61 
 
 		 630 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  31.63 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  33.33 
 
 		 617 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  29.6 
 
 		 610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  29.43 
 
 		 598 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  25.35 
 
 		 615 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  25.66 
 
 		 616 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  24.45 
 
 		 594 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  23.54 
 
 		 601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  25.48 
 
 		 616 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  25.48 
 
 		 616 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  25.31 
 
 		 616 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  25.52 
 
 		 615 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  28.8 
 
 		 621 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  23.68 
 
 		 602 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  24.36 
 
 		 619 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  23.96 
 
 		 603 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  34.12 
 
 		 227 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  24.5 
 
 		 595 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  25.68 
 
 		 599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  24.1 
 
 		 603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  23.69 
 
 		 627 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  24.5 
 
 		 624 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  25.65 
 
 		 615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  23.78 
 
 		 628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  24.04 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  24.73 
 
 		 616 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  26.18 
 
 		 615 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  25.6 
 
 		 625 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  25.13 
 
 		 636 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>