162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0683 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  999    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  62.08 
 
 
506 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  56.5 
 
 
522 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  49.1 
 
 
496 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  32.94 
 
 
581 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  29.57 
 
 
575 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  27.94 
 
 
628 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  25 
 
 
542 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  26.73 
 
 
582 aa  123  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  27.18 
 
 
542 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  28.16 
 
 
583 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  24.29 
 
 
592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  26.45 
 
 
590 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  24.03 
 
 
596 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  24.03 
 
 
596 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  30.07 
 
 
635 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  25.87 
 
 
590 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  25.24 
 
 
590 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  30.82 
 
 
554 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  23.6 
 
 
596 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  25.24 
 
 
590 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  25.24 
 
 
590 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  28 
 
 
592 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  28.16 
 
 
536 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  25.53 
 
 
599 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  23.79 
 
 
602 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  25 
 
 
592 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  26.5 
 
 
609 aa  100  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  25.57 
 
 
590 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  26.18 
 
 
591 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  26.55 
 
 
595 aa  99  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  27.24 
 
 
578 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  27.68 
 
 
540 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  29.61 
 
 
543 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  28.71 
 
 
609 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  31.73 
 
 
593 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  28.14 
 
 
611 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  28.17 
 
 
602 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  31.49 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  30.1 
 
 
594 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  27.31 
 
 
583 aa  73.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  27.83 
 
 
607 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  27.83 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  27.83 
 
 
607 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  29.19 
 
 
621 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  27.86 
 
 
639 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  25.56 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  28.17 
 
 
601 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  28.17 
 
 
601 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  30.51 
 
 
1283 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  29.46 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  28.64 
 
 
599 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  27.43 
 
 
611 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  29.46 
 
 
614 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  25.86 
 
 
609 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  28.17 
 
 
601 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  28.17 
 
 
603 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  29.25 
 
 
592 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  25.44 
 
 
544 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  28.17 
 
 
603 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  28.17 
 
 
603 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  28.17 
 
 
603 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  27.7 
 
 
601 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  25.86 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  25.86 
 
 
611 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  28.17 
 
 
603 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  28.19 
 
 
599 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  29.22 
 
 
619 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  29.46 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  30.27 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.72 
 
 
622 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  27.72 
 
 
614 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  30.35 
 
 
621 aa  70.1  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  29.25 
 
 
588 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  27.51 
 
 
585 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  27.7 
 
 
591 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  27.55 
 
 
633 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  28.16 
 
 
624 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  27.16 
 
 
635 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  27.16 
 
 
635 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  28.65 
 
 
635 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  29.17 
 
 
548 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  29.02 
 
 
617 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  28.72 
 
 
599 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  27.47 
 
 
616 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  29.9 
 
 
598 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  25 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  29.52 
 
 
629 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  24.53 
 
 
610 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  27.96 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  29.15 
 
 
610 aa  68.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  26.87 
 
 
589 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  28.93 
 
 
605 aa  67.8  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  28.65 
 
 
617 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  26.34 
 
 
627 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  30.1 
 
 
605 aa  67  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>