187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2949 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1326    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  30.18 
 
 		 596 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 592 aa  279  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  30.02 
 
 		 596 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  30.29 
 
 		 595 aa  278  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  30.02 
 
 		 596 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  30.4 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  29.61 
 
 		 592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  29.38 
 
 		 590 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  30.03 
 
 		 590 aa  266  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  29.66 
 
 		 590 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  29.34 
 
 		 590 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  29.02 
 
 		 590 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  28.2 
 
 		 591 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  28.85 
 
 		 592 aa  257  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  29.14 
 
 		 609 aa  253  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  28.76 
 
 		 590 aa  253  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  29.95 
 
 		 602 aa  250  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  28.85 
 
 		 599 aa  250  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  29.29 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  26.6 
 
 		 542 aa  195  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  28.65 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  25.51 
 
 		 542 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  29.06 
 
 		 554 aa  173  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  29.61 
 
 		 548 aa  160  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  25.29 
 
 		 628 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  24.49 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  23.71 
 
 		 575 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  30.36 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  22.82 
 
 		 583 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  30.07 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  23.56 
 
 		 581 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  27.86 
 
 		 554 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  22.59 
 
 		 544 aa  98.2  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  28.83 
 
 		 506 aa  98.2  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  26.07 
 
 		 496 aa  95.5  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  24.23 
 
 		 609 aa  90.9  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  23.84 
 
 		 589 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2038  hypothetical protein  25.13 
 
 		 579 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0262  hypothetical protein  25.65 
 
 		 621 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02810  hypothetical protein  22.65 
 
 		 596 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  23.72 
 
 		 622 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  27.73 
 
 		 610 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  24.64 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  25.86 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  24.57 
 
 		 635 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  22.54 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  25.11 
 
 		 227 aa  72  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  26.28 
 
 		 635 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  26.55 
 
 		 621 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  26.81 
 
 		 629 aa  72.4  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  26.28 
 
 		 635 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  25 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  26.42 
 
 		 628 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  25 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  22.69 
 
 		 617 aa  71.2  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  25 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  24.71 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  24.71 
 
 		 607 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  24.71 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1144  protein of unknown function DUF885  30.99 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2303  hypothetical protein  24.48 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2350  hypothetical protein  24.48 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2342  hypothetical protein  24.48 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.813286  decreased coverage  0.0014283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  29.95 
 
 		 621 aa  70.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  27.01 
 
 		 633 aa  70.5  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  24.8 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  25.5 
 
 		 611 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  29.12 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  24.61 
 
 		 617 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  28.82 
 
 		 625 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  25.97 
 
 		 546 aa  67  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  24.26 
 
 		 583 aa  66.6  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3863  protein of unknown function DUF885  24.18 
 
 		 600 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.292852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  27.38 
 
 		 614 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  27.75 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  28.42 
 
 		 619 aa  65.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  28.02 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3789  hypothetical protein  23.11 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25480  hypothetical protein  28.95 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.297294  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1015  protein of unknown function DUF885  22.84 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2741  hypothetical protein  22.42 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0365152  normal  0.772036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  26.59 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  25.36 
 
 		 568 aa  64.7  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  28.82 
 
 		 601 aa  64.3  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  28.49 
 
 		 593 aa  63.9  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  25 
 
 		 605 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  24.55 
 
 		 559 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  28.49 
 
 		 601 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  28.49 
 
 		 601 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  20.87 
 
 		 628 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  21.44 
 
 		 587 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1038  protein of unknown function DUF885  31.52 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  29.59 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0196  hypothetical protein  29.71 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.825624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  26.46 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  25.62 
 
 		 636 aa  62  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  27.91 
 
 		 601 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  27.12 
 
 		 547 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21140  hypothetical protein  29.23 
 
 		 563 aa  62  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.316254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>