134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0887 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1104    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  53.48 
 
 		 536 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  48.8 
 
 		 542 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  46.05 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  43.32 
 
 		 582 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  48.19 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  36.2 
 
 		 602 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  28.52 
 
 		 599 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  38.34 
 
 		 554 aa  243  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  29.34 
 
 		 592 aa  238  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 596 aa  233  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  29.06 
 
 		 590 aa  233  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  27.47 
 
 		 591 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  27.78 
 
 		 596 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  27.78 
 
 		 596 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  28.85 
 
 		 609 aa  230  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  28.67 
 
 		 590 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  28.26 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  28.26 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  28.37 
 
 		 592 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  27.24 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  28.08 
 
 		 590 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  27.55 
 
 		 590 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  29.06 
 
 		 635 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  26.01 
 
 		 542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  28.71 
 
 		 581 aa  133  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  25.67 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  27.14 
 
 		 628 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  29.4 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  27.79 
 
 		 583 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  27.9 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  26.57 
 
 		 506 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  28.93 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  23.67 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  28.1 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  24.81 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  24.81 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  24.89 
 
 		 622 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  24.3 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  24.3 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  24.3 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  23.59 
 
 		 611 aa  60.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  22.81 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  24.3 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  24.56 
 
 		 227 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  22.84 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  24.56 
 
 		 617 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  24.18 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  22.97 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  20.18 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  20.97 
 
 		 624 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  20.71 
 
 		 618 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  22.75 
 
 		 625 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  31.03 
 
 		 605 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  19.88 
 
 		 615 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  27.06 
 
 		 609 aa  54.3  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  21.67 
 
 		 613 aa  53.9  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  19.88 
 
 		 615 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  27.39 
 
 		 628 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  24.42 
 
 		 1283 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  22.76 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  28.3 
 
 		 598 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1442  protein of unknown function DUF885  22.92 
 
 		 594 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1279  hypothetical protein  27.48 
 
 		 561 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.59643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  25.79 
 
 		 547 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  20.47 
 
 		 602 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2312  protein of unknown function DUF885  26.55 
 
 		 555 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4632  protein of unknown function DUF885  27.54 
 
 		 561 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  22.56 
 
 		 618 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  41.27 
 
 		 587 aa  51.2  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  26.64 
 
 		 610 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  19.45 
 
 		 615 aa  50.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  21.79 
 
 		 610 aa  50.4  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  19.24 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  20.43 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  24.39 
 
 		 625 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  22.56 
 
 		 628 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  23.08 
 
 		 604 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0262  hypothetical protein  29.55 
 
 		 621 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  20 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  21.95 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  21.95 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  21.95 
 
 		 616 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  21.95 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  23.08 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  21.56 
 
 		 589 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  23.96 
 
 		 586 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  23.9 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0721  hypothetical protein  19.96 
 
 		 585 aa  48.9  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000070279  hitchhiker  0.000000054554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  24.35 
 
 		 546 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  23.9 
 
 		 599 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  22.64 
 
 		 602 aa  47.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  23.46 
 
 		 609 aa  47.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  26.42 
 
 		 621 aa  47.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  25.16 
 
 		 593 aa  47.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  22.84 
 
 		 616 aa  47  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  23.84 
 
 		 629 aa  47  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  22.22 
 
 		 609 aa  47  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>