32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2107 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1083    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  52.45 
 
 		 548 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  35.16 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  37.79 
 
 		 554 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  35.18 
 
 		 536 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  34.16 
 
 		 542 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  33.27 
 
 		 582 aa  213  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  27 
 
 		 602 aa  146  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  23.61 
 
 		 592 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  23.9 
 
 		 595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  22.59 
 
 		 596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  23.31 
 
 		 591 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  22.56 
 
 		 590 aa  120  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  22.42 
 
 		 596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  22.8 
 
 		 592 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  23.05 
 
 		 590 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  22.44 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  22.74 
 
 		 599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  22.97 
 
 		 590 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  22.97 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  28.15 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  22.8 
 
 		 590 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  22.75 
 
 		 592 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  22.93 
 
 		 590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  22.28 
 
 		 609 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  22.16 
 
 		 542 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  26.21 
 
 		 581 aa  87  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  25 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  24.28 
 
 		 619 aa  50.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  31.19 
 
 		 540 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  28.93 
 
 		 583 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  24.53 
 
 		 628 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>