179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0417 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
581 aa  1177    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  54.69 
 
 
575 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  32.42 
 
 
628 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  31.96 
 
 
502 aa  207  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  27.46 
 
 
542 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  32.26 
 
 
506 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  33.02 
 
 
522 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  28.19 
 
 
582 aa  166  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  25.55 
 
 
602 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  28.73 
 
 
536 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  27.38 
 
 
496 aa  150  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  26.43 
 
 
592 aa  150  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  25.29 
 
 
596 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  25.04 
 
 
596 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  25.29 
 
 
596 aa  143  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  24.91 
 
 
590 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  24.03 
 
 
592 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  24.41 
 
 
591 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  25.46 
 
 
595 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  23.98 
 
 
590 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  25.6 
 
 
609 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  23.81 
 
 
590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  23.81 
 
 
590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  24.92 
 
 
590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  24.32 
 
 
590 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  25.41 
 
 
592 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  27.35 
 
 
542 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  28.71 
 
 
554 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  28.62 
 
 
578 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  27.8 
 
 
583 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  23.75 
 
 
599 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  27.8 
 
 
540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  23.56 
 
 
635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  28.54 
 
 
543 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  22.9 
 
 
611 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  23.65 
 
 
585 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  22.67 
 
 
616 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  22.01 
 
 
609 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  23.89 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  24.63 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  24.63 
 
 
609 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  24.93 
 
 
607 aa  84  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  25.67 
 
 
609 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.97 
 
 
1283 aa  84  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  21.86 
 
 
589 aa  84  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  23.02 
 
 
611 aa  84  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  24.63 
 
 
609 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  26.36 
 
 
616 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  26.02 
 
 
629 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  28.64 
 
 
609 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  25.68 
 
 
610 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  25.72 
 
 
621 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  24.34 
 
 
609 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  24.34 
 
 
609 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  24.34 
 
 
609 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  30.53 
 
 
595 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  25 
 
 
554 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  28.19 
 
 
619 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  30.19 
 
 
633 aa  78.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  29.52 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  24.4 
 
 
599 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  22.93 
 
 
587 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  29.44 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  26.22 
 
 
611 aa  73.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  22.98 
 
 
593 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  30.91 
 
 
608 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  33.53 
 
 
611 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  32.52 
 
 
628 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  29.38 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  33.33 
 
 
635 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  23.98 
 
 
592 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  32.94 
 
 
598 aa  70.5  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  29.59 
 
 
601 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  31.67 
 
 
635 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  31.67 
 
 
635 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  30.18 
 
 
589 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  30.14 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  28.74 
 
 
601 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  28.74 
 
 
601 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  28.74 
 
 
601 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  29.17 
 
 
602 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  21.57 
 
 
591 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  24.62 
 
 
584 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  29.59 
 
 
603 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  26.29 
 
 
614 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  29.59 
 
 
603 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  29.59 
 
 
603 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  29.59 
 
 
603 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  30.43 
 
 
617 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  29.94 
 
 
590 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  26.29 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  29.59 
 
 
603 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  26.05 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  33.53 
 
 
613 aa  67.8  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  26.05 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  26.29 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  26.05 
 
 
607 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  26.45 
 
 
628 aa  67.4  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  32.53 
 
 
635 aa  67  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  26.05 
 
 
614 aa  67  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>