180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1181 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  100 
 
 
506 aa  1001    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  62.08 
 
 
502 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  63.16 
 
 
522 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  47.52 
 
 
496 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  32.33 
 
 
581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  30.31 
 
 
575 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  29.48 
 
 
628 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  25 
 
 
542 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  29.37 
 
 
542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  24.11 
 
 
602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  27.57 
 
 
582 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  33.23 
 
 
583 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  27.36 
 
 
590 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  27.67 
 
 
590 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  26.81 
 
 
590 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  26.81 
 
 
590 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  26.81 
 
 
590 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  28.43 
 
 
596 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  27.27 
 
 
592 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  28.12 
 
 
596 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  27.51 
 
 
592 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  28.12 
 
 
596 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  26.96 
 
 
599 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  29.51 
 
 
536 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  27.33 
 
 
590 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  27.48 
 
 
592 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  28.83 
 
 
635 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  25.41 
 
 
591 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  28.84 
 
 
540 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  26.97 
 
 
609 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  27 
 
 
595 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  28.31 
 
 
578 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  32.52 
 
 
543 aa  87.4  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  32.95 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  30.15 
 
 
585 aa  84  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  29.21 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  33.33 
 
 
639 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  30.73 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  34.16 
 
 
611 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.57 
 
 
608 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  30.77 
 
 
630 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  31.68 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  30.81 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  30.81 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  30.48 
 
 
590 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  30.81 
 
 
611 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  31.61 
 
 
583 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  30.23 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  30.81 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  32.2 
 
 
598 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  24.74 
 
 
621 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  24.24 
 
 
1283 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  32.35 
 
 
617 aa  73.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  31.79 
 
 
586 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  30.43 
 
 
629 aa  73.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  30.23 
 
 
609 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  30.23 
 
 
609 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  30.23 
 
 
609 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  30.23 
 
 
609 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  33.14 
 
 
614 aa  73.6  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  31.95 
 
 
616 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  29.47 
 
 
611 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  30.36 
 
 
610 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  31.03 
 
 
633 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  30.36 
 
 
607 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  27.96 
 
 
599 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  30.64 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  29.35 
 
 
605 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  32.3 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  30.95 
 
 
616 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  30.64 
 
 
646 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  30.6 
 
 
635 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  32.3 
 
 
607 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  30.6 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  32.3 
 
 
607 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  30.36 
 
 
602 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  32.3 
 
 
607 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  30.43 
 
 
610 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  29 
 
 
613 aa  72  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  32.3 
 
 
614 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  30.6 
 
 
635 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  30.64 
 
 
603 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  29.65 
 
 
611 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  32.1 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  32.37 
 
 
617 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  29.31 
 
 
602 aa  70.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  29.5 
 
 
624 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.32 
 
 
587 aa  70.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  32.3 
 
 
614 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  31.68 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.93 
 
 
622 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  30.64 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  30.64 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  32.93 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  30.64 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  30.64 
 
 
601 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  34.52 
 
 
584 aa  70.5  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  30.64 
 
 
603 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  30.64 
 
 
603 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  29.76 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>