169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1385 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1181    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  54.69 
 
 		 581 aa  625  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  33.52 
 
 		 628 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  29.57 
 
 		 502 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  30.5 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  27.38 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  27.92 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  29.09 
 
 		 522 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  26.39 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  25.82 
 
 		 596 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  26.39 
 
 		 596 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  25.95 
 
 		 602 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  25.8 
 
 		 592 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  27 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  25.44 
 
 		 590 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  26.91 
 
 		 592 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  25.14 
 
 		 590 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  25.14 
 
 		 590 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  26.99 
 
 		 542 aa  150  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  25.09 
 
 		 590 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  25.8 
 
 		 591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  26.36 
 
 		 592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  24.95 
 
 		 590 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  26.6 
 
 		 590 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  26.63 
 
 		 599 aa  143  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  25.33 
 
 		 536 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  26.33 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  25.27 
 
 		 609 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  25.99 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  23.71 
 
 		 635 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  24.87 
 
 		 578 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  25.36 
 
 		 548 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  24.41 
 
 		 540 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  25.67 
 
 		 543 aa  93.6  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  30.81 
 
 		 609 aa  90.1  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  23.48 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  23.27 
 
 		 587 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  25.1 
 
 		 583 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  25 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  22.28 
 
 		 544 aa  78.2  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  31.55 
 
 		 619 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  21.73 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  21.86 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  31.4 
 
 		 607 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  21.73 
 
 		 635 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  21.86 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  21.86 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  31.4 
 
 		 1283 aa  74.7  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  21.73 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  21.51 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  21.78 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  29.41 
 
 		 595 aa  72.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  21.68 
 
 		 601 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  21.18 
 
 		 601 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  21.36 
 
 		 601 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  21.15 
 
 		 594 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  20.83 
 
 		 603 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  21.91 
 
 		 592 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  21.01 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  29.07 
 
 		 609 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  30.49 
 
 		 608 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  29.41 
 
 		 621 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  29.07 
 
 		 611 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  27.98 
 
 		 609 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  30.49 
 
 		 608 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  31.25 
 
 		 605 aa  69.7  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  29.07 
 
 		 609 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 616 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  27.38 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  20.71 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  27.98 
 
 		 617 aa  68.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  22.01 
 
 		 599 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  30.05 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  29.65 
 
 		 616 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  27.38 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  27.38 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  29.07 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  27.38 
 
 		 609 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  29.41 
 
 		 607 aa  67  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  29.41 
 
 		 607 aa  67  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  29.41 
 
 		 607 aa  67  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  26.79 
 
 		 609 aa  66.6  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  28.49 
 
 		 609 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  21.57 
 
 		 588 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  29.78 
 
 		 633 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  27.51 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  21.51 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  28.3 
 
 		 614 aa  65.1  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  28.05 
 
 		 610 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  21.84 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  30.54 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  28.1 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  28.66 
 
 		 614 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  28.3 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  24.4 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  28.66 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  28 
 
 		 636 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  24.43 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  19.64 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  27.66 
 
 		 610 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>