163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4171 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  988    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  49.1 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  47.52 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  42.57 
 
 		 522 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  29.51 
 
 		 581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  28.19 
 
 		 628 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  29.23 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  26.08 
 
 		 575 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  26.45 
 
 		 609 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  24.86 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  27.17 
 
 		 592 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  24.62 
 
 		 591 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  25.65 
 
 		 590 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  24.68 
 
 		 599 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  24.26 
 
 		 590 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  25.47 
 
 		 592 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  33.33 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  25.16 
 
 		 590 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  24.68 
 
 		 595 aa  100  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  23.78 
 
 		 590 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  23.78 
 
 		 590 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  23.78 
 
 		 590 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  23.56 
 
 		 596 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  26.38 
 
 		 544 aa  97.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  23.56 
 
 		 596 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  25 
 
 		 592 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  26.07 
 
 		 635 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  30.06 
 
 		 583 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  23.56 
 
 		 596 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  22.2 
 
 		 602 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 540 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  26.7 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  32.94 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  31.61 
 
 		 227 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  34.29 
 
 		 619 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  32.18 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  32.18 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  32.18 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.68 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  32.5 
 
 		 610 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  32.14 
 
 		 609 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  31.61 
 
 		 614 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  31.55 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  31.55 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  31.55 
 
 		 611 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  31.61 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  31.55 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  30.95 
 
 		 609 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  30.34 
 
 		 622 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  31.61 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  31.61 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  30.36 
 
 		 616 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  30.59 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  30.59 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  30.59 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  30.59 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  31.36 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  30.95 
 
 		 611 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  30.36 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  29.76 
 
 		 607 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  30.23 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  32.35 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  29.76 
 
 		 610 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  32.16 
 
 		 630 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  27.96 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  32.37 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  29.89 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  30.81 
 
 		 595 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  25.76 
 
 		 616 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  30.41 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  33.71 
 
 		 621 aa  73.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  27.54 
 
 		 585 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  26.21 
 
 		 536 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  29.8 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  31.82 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  26.04 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  26.04 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  26.04 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  29.82 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  31.58 
 
 		 587 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  28.07 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  24.7 
 
 		 1283 aa  70.1  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  32.34 
 
 		 614 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  33.53 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  33.53 
 
 		 635 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  29.34 
 
 		 636 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  30.88 
 
 		 624 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  28.99 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.14 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  29.94 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  27.4 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  29.34 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  29.34 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  31.46 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  29.34 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  29.34 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  29.34 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  29.94 
 
 		 551 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  27.01 
 
 		 611 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  27.05 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>