191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1391 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
583 aa  1179    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  53.93 
 
 
540 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  54.33 
 
 
543 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  29.6 
 
 
542 aa  256  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  27.65 
 
 
614 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  27.65 
 
 
614 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.29 
 
 
614 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  25.59 
 
 
608 aa  130  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  27.43 
 
 
617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  28.6 
 
 
502 aa  128  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  26.57 
 
 
607 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  26.57 
 
 
607 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  26.57 
 
 
607 aa  127  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  29.82 
 
 
622 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  27.55 
 
 
628 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  27.49 
 
 
609 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  25.65 
 
 
611 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  31.02 
 
 
609 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  31.02 
 
 
609 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  31.02 
 
 
609 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  31.02 
 
 
609 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  25.43 
 
 
614 aa  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  24.51 
 
 
635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  30.72 
 
 
609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  30.72 
 
 
611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  30.39 
 
 
609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  30.75 
 
 
619 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  27.73 
 
 
607 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  30.72 
 
 
609 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  29.81 
 
 
1283 aa  122  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  30.72 
 
 
609 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  31.05 
 
 
611 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  26.37 
 
 
613 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  29.07 
 
 
616 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  28.88 
 
 
610 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  33.66 
 
 
633 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  29.7 
 
 
593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  31.83 
 
 
506 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  34.12 
 
 
595 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  28.4 
 
 
599 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  26.19 
 
 
602 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  27.8 
 
 
581 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  27.93 
 
 
628 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  24.35 
 
 
596 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  28.69 
 
 
616 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  24.35 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  29.73 
 
 
609 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  25.65 
 
 
629 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  28.14 
 
 
628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  30.27 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  26.45 
 
 
611 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  25.1 
 
 
592 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  35.56 
 
 
610 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  35.15 
 
 
586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  24.15 
 
 
596 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  28.61 
 
 
609 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  24.42 
 
 
592 aa  113  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  24.28 
 
 
615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  25.79 
 
 
590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  25.05 
 
 
590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  25.05 
 
 
590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  31.11 
 
 
227 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  26.87 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  25.05 
 
 
590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.07 
 
 
610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  27.58 
 
 
621 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  25.23 
 
 
544 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  34.58 
 
 
589 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  27.09 
 
 
566 aa  111  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  25.16 
 
 
599 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  27.23 
 
 
625 aa  110  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  26.94 
 
 
582 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  24.24 
 
 
615 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  22.84 
 
 
624 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  35.54 
 
 
589 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  28.88 
 
 
621 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  27.57 
 
 
614 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  24.24 
 
 
615 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  35.71 
 
 
602 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  24 
 
 
602 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  30.95 
 
 
604 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  28.09 
 
 
592 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  25.44 
 
 
613 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  33.33 
 
 
608 aa  107  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  35.76 
 
 
619 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 
608 aa  107  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  30.65 
 
 
547 aa  107  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  35.58 
 
 
601 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  28.96 
 
 
546 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1442  protein of unknown function DUF885  25.94 
 
 
594 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  24 
 
 
614 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.33 
 
 
587 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  25.44 
 
 
605 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  28.61 
 
 
636 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  35.8 
 
 
601 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  35.8 
 
 
601 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  35.8 
 
 
601 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  24 
 
 
592 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  27.93 
 
 
599 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  25.96 
 
 
617 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>