More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0371 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0371  primosomal protein N'  100 
 
 		 643 aa  1300    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  40.81 
 
 		 715 aa  515  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  39.37 
 
 		 804 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  38.37 
 
 		 745 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  41.18 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  41.18 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  40.97 
 
 		 801 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  41.18 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  41.18 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  41.18 
 
 		 801 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  41.18 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  39.31 
 
 		 802 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  41.18 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  41.74 
 
 		 801 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  39.31 
 
 		 802 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  41.18 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  38.98 
 
 		 781 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  39.68 
 
 		 802 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  41.04 
 
 		 790 aa  409  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  34.06 
 
 		 660 aa  409  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  40.37 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  38.84 
 
 		 732 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  37.93 
 
 		 809 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  36.95 
 
 		 661 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  38.36 
 
 		 798 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  36.69 
 
 		 732 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  37.05 
 
 		 796 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  38.52 
 
 		 801 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  39.34 
 
 		 749 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  33.61 
 
 		 813 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  38.64 
 
 		 747 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  38.07 
 
 		 775 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  38.51 
 
 		 798 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  35.97 
 
 		 810 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  34.93 
 
 		 858 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  39.07 
 
 		 731 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  37.46 
 
 		 724 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  39.07 
 
 		 731 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  37.02 
 
 		 815 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  36.08 
 
 		 730 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  34.81 
 
 		 752 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  34.83 
 
 		 828 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  34.36 
 
 		 735 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  35.79 
 
 		 768 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  35.23 
 
 		 738 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  33.8 
 
 		 803 aa  375  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  36.01 
 
 		 744 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  38.68 
 
 		 810 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  38.22 
 
 		 824 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  35.14 
 
 		 752 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  33.16 
 
 		 745 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  32.48 
 
 		 679 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  37.78 
 
 		 812 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  35.81 
 
 		 804 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  34.99 
 
 		 831 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  36.43 
 
 		 803 aa  370  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  33.87 
 
 		 738 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  37.48 
 
 		 810 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  36.57 
 
 		 815 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  34.68 
 
 		 786 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4126  primosomal protein N'  37.45 
 
 		 743 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000536083  hitchhiker  0.00000144445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  38.28 
 
 		 815 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  37.4 
 
 		 815 aa  365  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  34.92 
 
 		 814 aa  364  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  36.45 
 
 		 802 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  36.64 
 
 		 815 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  33.66 
 
 		 751 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  34.77 
 
 		 758 aa  361  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  34.22 
 
 		 695 aa  359  8e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  37.67 
 
 		 811 aa  359  9e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  35.39 
 
 		 821 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  34.05 
 
 		 832 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  35.51 
 
 		 780 aa  357  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  36.1 
 
 		 815 aa  357  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  33.33 
 
 		 805 aa  357  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  37.23 
 
 		 818 aa  356  6.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  35.2 
 
 		 754 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  32.48 
 
 		 746 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  32.69 
 
 		 732 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  37.39 
 
 		 759 aa  353  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  31.32 
 
 		 662 aa  352  2e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  31 
 
 		 662 aa  349  7e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  36.11 
 
 		 770 aa  348  1e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_002620  TC0159  primosome assembly protein PriA  35.48 
 
 		 753 aa  348  1e-94  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 739 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  33.63 
 
 		 835 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  32.74 
 
 		 835 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  33.33 
 
 		 739 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  35.78 
 
 		 815 aa  347  4e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  36.24 
 
 		 731 aa  347  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  38.52 
 
 		 812 aa  347  6e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  36.28 
 
 		 730 aa  346  7e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  32.74 
 
 		 746 aa  346  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  31.99 
 
 		 868 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  34.97 
 
 		 720 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  34.97 
 
 		 720 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  33.15 
 
 		 739 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  33.27 
 
 		 731 aa  344  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  32.73 
 
 		 727 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  34.97 
 
 		 733 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>