55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3581 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  89.11 
 
 		 359 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  85.11 
 
 		 359 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  42.21 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  38.22 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0343  ferredoxin  36.64 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.799415  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  30.54 
 
 		 639 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.97 
 
 		 658 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.56 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.1 
 
 		 258 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  30.74 
 
 		 257 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  32.51 
 
 		 258 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  29.61 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  27.35 
 
 		 241 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  25.22 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  25.42 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  24.57 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  30.19 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  28.22 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  24.45 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  26.56 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  25.23 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  24 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  24.78 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  26.72 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  29.44 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  25.89 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  27.85 
 
 		 241 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  24.55 
 
 		 234 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  46.15 
 
 		 499 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  24.44 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  48.98 
 
 		 554 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  38.24 
 
 		 612 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  42.86 
 
 		 611 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  42.55 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  39.66 
 
 		 616 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  25.11 
 
 		 497 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  30.67 
 
 		 517 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  47.73 
 
 		 685 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  30.34 
 
 		 605 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  33.33 
 
 		 534 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  25.35 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  23.77 
 
 		 519 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  25.56 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  24.88 
 
 		 221 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  38.46 
 
 		 592 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  40.38 
 
 		 592 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  30.26 
 
 		 538 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.41 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  24.08 
 
 		 221 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  35.44 
 
 		 612 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  34.18 
 
 		 592 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>