126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0428 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  100 
 
 
605 aa  1225    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  42.88 
 
 
821 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  40.89 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  41 
 
 
614 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  36.82 
 
 
616 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  36.03 
 
 
592 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  35.87 
 
 
592 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  35.8 
 
 
608 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  40.3 
 
 
581 aa  379  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  36.09 
 
 
610 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  35.53 
 
 
592 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  39.52 
 
 
570 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  35.97 
 
 
615 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  33.5 
 
 
638 aa  345  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  33.88 
 
 
606 aa  344  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  33.94 
 
 
612 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  34.81 
 
 
611 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  34.87 
 
 
622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  31.87 
 
 
618 aa  329  7e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  31.99 
 
 
635 aa  319  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  33 
 
 
627 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  33.68 
 
 
612 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  31.48 
 
 
657 aa  312  9e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  32.39 
 
 
558 aa  312  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  32.2 
 
 
642 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  34.26 
 
 
647 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  30.77 
 
 
630 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  32.9 
 
 
647 aa  303  9e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  31.72 
 
 
635 aa  300  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  31.16 
 
 
644 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.53 
 
 
683 aa  280  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  31.09 
 
 
690 aa  277  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  31.29 
 
 
612 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  36.88 
 
 
529 aa  276  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  28.69 
 
 
650 aa  273  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  38.99 
 
 
535 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  31.92 
 
 
539 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  29.03 
 
 
652 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  29.52 
 
 
640 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  29.52 
 
 
640 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  28.71 
 
 
673 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  29.84 
 
 
673 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  29.43 
 
 
640 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  28.37 
 
 
615 aa  259  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 
537 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  29.34 
 
 
640 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  30.11 
 
 
627 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  28.82 
 
 
694 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  28.55 
 
 
673 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  30.48 
 
 
521 aa  253  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  29.61 
 
 
679 aa  253  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  35.22 
 
 
426 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  32.46 
 
 
512 aa  229  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  29.08 
 
 
549 aa  227  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  32.37 
 
 
424 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  26.66 
 
 
538 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  32.54 
 
 
427 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  31.89 
 
 
417 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  31.41 
 
 
417 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  32.06 
 
 
416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  26.84 
 
 
555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  29.71 
 
 
410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  27.43 
 
 
499 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.16 
 
 
685 aa  150  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.79 
 
 
534 aa  134  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.88 
 
 
554 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  24.21 
 
 
514 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.67 
 
 
530 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  27.15 
 
 
540 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  26.96 
 
 
541 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.67 
 
 
535 aa  97.8  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.37 
 
 
540 aa  97.8  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  22.08 
 
 
639 aa  90.5  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.01 
 
 
539 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  39.24 
 
 
119 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2678  ferredoxin  37.65 
 
 
104 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0350247  normal  0.431777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.64 
 
 
372 aa  57.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  37.97 
 
 
119 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  29.63 
 
 
369 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.18 
 
 
407 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  30 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4909  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.35 
 
 
459 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.37 
 
 
437 aa  54.7  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.25 
 
 
408 aa  54.3  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  39.06 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  32.5 
 
 
434 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.03 
 
 
407 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.21 
 
 
408 aa  51.2  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.42 
 
 
431 aa  50.4  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.92 
 
 
407 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  31.03 
 
 
111 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.12 
 
 
407 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.68 
 
 
411 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  24.24 
 
 
411 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  32.32 
 
 
111 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.39 
 
 
412 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  35 
 
 
160 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  37.8 
 
 
92 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 
575 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  32.05 
 
 
160 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>