97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1306 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  100 
 
 		 538 aa  1098    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  32.78 
 
 		 612 aa  224  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  35.24 
 
 		 635 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  26.5 
 
 		 558 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  26.23 
 
 		 570 aa  217  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  28.01 
 
 		 610 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  29.59 
 
 		 618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  26.66 
 
 		 605 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  26.2 
 
 		 592 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  27.15 
 
 		 598 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  25.86 
 
 		 592 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  32.94 
 
 		 615 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  27.32 
 
 		 611 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  29.49 
 
 		 539 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  27.55 
 
 		 614 aa  203  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  27.44 
 
 		 616 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  32.78 
 
 		 647 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  33.33 
 
 		 630 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  25.52 
 
 		 592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  28.03 
 
 		 606 aa  200  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  26.2 
 
 		 821 aa  200  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  31.98 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  29.17 
 
 		 612 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  27.94 
 
 		 549 aa  189  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  31.19 
 
 		 657 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  30.19 
 
 		 581 aa  187  5e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  31.89 
 
 		 627 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  31.71 
 
 		 652 aa  183  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  33.33 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.82 
 
 		 650 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  25.42 
 
 		 608 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  31.44 
 
 		 622 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  28.63 
 
 		 644 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  31.89 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  29.29 
 
 		 521 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  30.62 
 
 		 640 aa  171  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  31.03 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  30.84 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  30.22 
 
 		 640 aa  170  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  30.22 
 
 		 640 aa  170  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  28.61 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  31.58 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  29.37 
 
 		 615 aa  166  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  28.87 
 
 		 635 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  28.08 
 
 		 627 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  31.34 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.7 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  29.63 
 
 		 642 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  30.41 
 
 		 537 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  31.41 
 
 		 612 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  28.32 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  26.71 
 
 		 683 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  29.66 
 
 		 673 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  28.97 
 
 		 673 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  29.1 
 
 		 555 aa  147  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  28.16 
 
 		 694 aa  146  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  27 
 
 		 534 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  27.8 
 
 		 647 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  28.33 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  28.29 
 
 		 499 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  27.67 
 
 		 410 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  28.81 
 
 		 679 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  29.74 
 
 		 673 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  28.04 
 
 		 690 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.19 
 
 		 685 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.72 
 
 		 554 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  24.83 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.15 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  26.26 
 
 		 539 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  26.5 
 
 		 541 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  25.29 
 
 		 530 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  26.71 
 
 		 514 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.77 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.91 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.06 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  29.37 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  30.95 
 
 		 575 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 574 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.62 
 
 		 407 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  33.78 
 
 		 369 aa  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1325  ferredoxin  29.69 
 
 		 118 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.530714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.51 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.6 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  38.67 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.63 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.43 
 
 		 338 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  38.67 
 
 		 411 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.53 
 
 		 437 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  35.06 
 
 		 580 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.67 
 
 		 407 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  26.32 
 
 		 226 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.62 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 		 547 aa  44.3  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  37.33 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.93 
 
 		 346 aa  43.5  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>