94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0649 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1243    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  35.11 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  32.5 
 
 		 821 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  34.12 
 
 		 618 aa  321  3e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  33.45 
 
 		 608 aa  319  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  33.17 
 
 		 616 aa  317  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  31.85 
 
 		 614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  32.84 
 
 		 615 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  33.83 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  31.29 
 
 		 605 aa  300  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  31.48 
 
 		 570 aa  298  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  32.15 
 
 		 612 aa  293  5e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  34.33 
 
 		 612 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  34.33 
 
 		 647 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  32.9 
 
 		 657 aa  290  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  29.34 
 
 		 592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  29.24 
 
 		 592 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  32.01 
 
 		 642 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  29.34 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  30.83 
 
 		 611 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  32.67 
 
 		 635 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  29.92 
 
 		 647 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  31.14 
 
 		 635 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  29.81 
 
 		 638 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  30.15 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  30.42 
 
 		 627 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  32.78 
 
 		 622 aa  267  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  31.57 
 
 		 683 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  30.66 
 
 		 581 aa  259  8e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  28.92 
 
 		 644 aa  259  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  29.78 
 
 		 652 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  31.02 
 
 		 558 aa  257  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  31.68 
 
 		 690 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  31.08 
 
 		 627 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  31.42 
 
 		 640 aa  250  6e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  36.3 
 
 		 539 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  31.74 
 
 		 615 aa  249  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  32.62 
 
 		 673 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.4 
 
 		 650 aa  248  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  30.64 
 
 		 679 aa  247  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  30.26 
 
 		 694 aa  247  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  32.45 
 
 		 673 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  34.93 
 
 		 535 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  36.26 
 
 		 630 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  33.83 
 
 		 537 aa  242  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  30.63 
 
 		 673 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  29.33 
 
 		 549 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  36.52 
 
 		 424 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  31.32 
 
 		 640 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  30.44 
 
 		 640 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  30.44 
 
 		 640 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  33.17 
 
 		 521 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  36.49 
 
 		 512 aa  230  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  33.64 
 
 		 529 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  33.17 
 
 		 426 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  31.31 
 
 		 427 aa  204  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  32.12 
 
 		 417 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  31.41 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  32.08 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  32.36 
 
 		 417 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  29.47 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  29.93 
 
 		 410 aa  147  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.18 
 
 		 685 aa  134  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  28.31 
 
 		 534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  25.97 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  26.56 
 
 		 514 aa  115  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  25.9 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.21 
 
 		 540 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.67 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  25.23 
 
 		 540 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  25.81 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.2 
 
 		 539 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.88 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  35.62 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.8 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.93 
 
 		 411 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.93 
 
 		 411 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.11 
 
 		 365 aa  54.7  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.14 
 
 		 372 aa  54.3  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.9 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.05 
 
 		 639 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 		 346 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  38.46 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.03 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.39 
 
 		 407 aa  48.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.66 
 
 		 408 aa  47  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.29 
 
 		 437 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56260  hypothetical protein  38.96 
 
 		 308 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.66 
 
 		 407 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  41.43 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  41.38 
 
 		 119 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4900  hypothetical protein  34.57 
 
 		 309 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.08 
 
 		 410 aa  43.5  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  40 
 
 		 360 aa  43.5  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>