74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3848 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  856    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  60.38 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  61.39 
 
 		 426 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  56.64 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  57.11 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  56.42 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  41.99 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  36.41 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  32.7 
 
 		 592 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  32.7 
 
 		 592 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  33.96 
 
 		 616 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  33.73 
 
 		 821 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  34.45 
 
 		 598 aa  229  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  33.57 
 
 		 615 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  31.74 
 
 		 592 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  35.78 
 
 		 539 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  33.02 
 
 		 608 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  35.42 
 
 		 581 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  32.71 
 
 		 614 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  32.78 
 
 		 605 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  34.6 
 
 		 611 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  31.98 
 
 		 570 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  31.99 
 
 		 606 aa  213  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  35.51 
 
 		 612 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  32.46 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  31.82 
 
 		 635 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  32.39 
 
 		 657 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  33.26 
 
 		 630 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.55 
 
 		 558 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  33.1 
 
 		 622 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  31.65 
 
 		 618 aa  194  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  30.88 
 
 		 638 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  30.34 
 
 		 652 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  29.77 
 
 		 627 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  30.45 
 
 		 647 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  31.31 
 
 		 612 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  31.44 
 
 		 690 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  31.57 
 
 		 640 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  31.49 
 
 		 647 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  31.49 
 
 		 555 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  32.13 
 
 		 673 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.61 
 
 		 650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  31 
 
 		 673 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  29.49 
 
 		 642 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  30.84 
 
 		 538 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  31.63 
 
 		 640 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  31.63 
 
 		 640 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  30.02 
 
 		 644 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  30.89 
 
 		 673 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  31.4 
 
 		 640 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  31.81 
 
 		 679 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  29.75 
 
 		 694 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  28.51 
 
 		 635 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  28.11 
 
 		 683 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.32 
 
 		 685 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  30.82 
 
 		 549 aa  153  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  30.98 
 
 		 521 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  29.62 
 
 		 627 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  28.38 
 
 		 535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  27.29 
 
 		 529 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  27.71 
 
 		 537 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  31.08 
 
 		 534 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  29.91 
 
 		 615 aa  142  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  29.38 
 
 		 512 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  31.06 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.75 
 
 		 554 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  29.08 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.11 
 
 		 530 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  29 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.94 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  24.11 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.67 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  25.44 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.87 
 
 		 639 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>