74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3190 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 
521 aa  1054    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  43.59 
 
 
537 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  38.9 
 
 
529 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  38.02 
 
 
647 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  39.61 
 
 
635 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  35.48 
 
 
638 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  38.39 
 
 
657 aa  359  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  39.65 
 
 
642 aa  352  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  35.21 
 
 
535 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  35.56 
 
 
627 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  40.16 
 
 
512 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  37.62 
 
 
635 aa  345  8.999999999999999e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  39.22 
 
 
622 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  37.33 
 
 
630 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  34.77 
 
 
652 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  33.59 
 
 
644 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  34.64 
 
 
650 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  32.37 
 
 
640 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
640 aa  315  9e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  32.95 
 
 
640 aa  312  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  32.95 
 
 
640 aa  312  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  35.13 
 
 
618 aa  296  8e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  31.8 
 
 
614 aa  286  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  36.18 
 
 
627 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  32.74 
 
 
608 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  32.02 
 
 
612 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  32.56 
 
 
690 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  32.3 
 
 
616 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  33.96 
 
 
615 aa  261  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  34.1 
 
 
673 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  34.1 
 
 
673 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  32.31 
 
 
694 aa  256  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  30.68 
 
 
598 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.84 
 
 
683 aa  246  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  33.09 
 
 
581 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  33.46 
 
 
673 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  29.6 
 
 
605 aa  243  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  31.66 
 
 
679 aa  243  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  30.51 
 
 
615 aa  238  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  32.17 
 
 
612 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  30.43 
 
 
821 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  28.7 
 
 
647 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  30.59 
 
 
611 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  30.07 
 
 
592 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  32.27 
 
 
570 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  29.71 
 
 
592 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  30.43 
 
 
592 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  31.49 
 
 
549 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  29.75 
 
 
610 aa  206  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  33.17 
 
 
612 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  29.57 
 
 
606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  31.07 
 
 
539 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  27.11 
 
 
558 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  29.29 
 
 
538 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  31.25 
 
 
424 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  29.44 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  30.98 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  30.52 
 
 
426 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  28.5 
 
 
417 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  30.7 
 
 
416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  30.43 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  28.82 
 
 
555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  29.08 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  29.09 
 
 
499 aa  118  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.49 
 
 
554 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.59 
 
 
685 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  26.51 
 
 
514 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  25.23 
 
 
541 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  26.9 
 
 
540 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.89 
 
 
539 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.59 
 
 
540 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.78 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.03 
 
 
535 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.31 
 
 
639 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>