132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15350 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  100 
 
 
598 aa  1211    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  43.4 
 
 
821 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  41.73 
 
 
614 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  40.89 
 
 
605 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  38.82 
 
 
616 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  37.79 
 
 
608 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  35.9 
 
 
635 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  37.5 
 
 
592 aa  363  6e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  37.36 
 
 
592 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  38.23 
 
 
592 aa  360  5e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  37.6 
 
 
570 aa  359  9e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  36.28 
 
 
612 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  37.6 
 
 
581 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  33.5 
 
 
618 aa  340  4e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  37.16 
 
 
611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  34.74 
 
 
638 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  35.92 
 
 
610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  34.05 
 
 
657 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  33.95 
 
 
615 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  35.8 
 
 
606 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  35.04 
 
 
622 aa  327  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  35.06 
 
 
612 aa  323  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  33.5 
 
 
642 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  35.11 
 
 
612 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  33.44 
 
 
635 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  33.49 
 
 
647 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  32.96 
 
 
650 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  32.2 
 
 
647 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  31.03 
 
 
644 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  33.16 
 
 
558 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  31.91 
 
 
630 aa  289  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  33.11 
 
 
627 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  33.17 
 
 
652 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  36.71 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  31.09 
 
 
683 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  33.87 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  33.74 
 
 
539 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  31.83 
 
 
640 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  32.41 
 
 
640 aa  273  7e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  31.5 
 
 
640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  31.5 
 
 
640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  32.42 
 
 
615 aa  261  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  30.11 
 
 
690 aa  261  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  29.74 
 
 
694 aa  253  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  33.01 
 
 
521 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  30.84 
 
 
627 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  34.01 
 
 
512 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  35.98 
 
 
426 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  29.95 
 
 
549 aa  243  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  27.72 
 
 
673 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  29.77 
 
 
679 aa  240  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  27.72 
 
 
673 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  33.96 
 
 
537 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  28.48 
 
 
673 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  35.97 
 
 
424 aa  231  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  34.45 
 
 
427 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  32.94 
 
 
416 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  27.15 
 
 
538 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  32.13 
 
 
417 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  32.13 
 
 
417 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  32.2 
 
 
410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  27.88 
 
 
555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  29.12 
 
 
499 aa  146  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.46 
 
 
534 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.11 
 
 
685 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  26.35 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  26.36 
 
 
541 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.93 
 
 
554 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  27.31 
 
 
540 aa  117  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.39 
 
 
540 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  25.54 
 
 
514 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  26.28 
 
 
539 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.77 
 
 
535 aa  98.6  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.04 
 
 
639 aa  87.4  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  37.4 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36 
 
 
407 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.15 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.48 
 
 
407 aa  62  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 
407 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36 
 
 
372 aa  61.2  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.52 
 
 
407 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.97 
 
 
407 aa  59.7  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.56 
 
 
411 aa  58.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  32.67 
 
 
369 aa  58.5  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35 
 
 
437 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.07 
 
 
407 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2109  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.4 
 
 
411 aa  57  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.52 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.94 
 
 
412 aa  57  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.74 
 
 
431 aa  56.2  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.72 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  33.33 
 
 
119 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.94 
 
 
408 aa  55.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
574 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  32.53 
 
 
119 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  36.99 
 
 
578 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  38.2 
 
 
277 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  30.77 
 
 
434 aa  52.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  44.44 
 
 
123 aa  51.6  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>